Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 AC007683.2-201ENST00000624681 714 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 DMD-228ENST00000541735 7080 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 ARIH1-201ENST00000379887 21681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 AC003973.3-201ENST00000624863 2822 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 CLEC1A-204ENST00000457018 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 OR6C65-201ENST00000379665 1076 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 IL23R-203ENST00000425614 1295 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 AC019185.1-201ENST00000442718 389 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 PPIA-203ENST00000451562 544 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 IGBP1P4-201ENST00000503202 879 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 EDNRA-204ENST00000506066 1032 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 AC010387.1-201ENST00000507526 487 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 AC138866.2-201ENST00000508650 584 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 CA3-AS1-203ENST00000524052 430 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 OR8G3P-201ENST00000533406 921 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 AC114947.2-202ENST00000569313 643 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 AC139099.3-202ENST00000574856 439 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 AC100767.2-201ENST00000604840 693 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 AL160400.1-201ENST00000606385 1030 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 AC012564.1-201ENST00000636802 557 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 ALG10B-201ENST00000308742 10253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 AC006600.2-201ENST00000624834 2506 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 FSHB-202ENST00000417547 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 RGS6-204ENST00000404301 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 OR2J2-203ENST00000641417 2392 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 AC089998.1-201ENST00000548575 3141 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 EPPIN-202ENST00000354280 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 ZSCAN4-202ENST00000612521 1979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 SVBP-202ENST00000372522 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 CCDC178-202ENST00000383096 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 RNU2-18P-201ENST00000411224 162 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 AKR1B10P1-201ENST00000425765 942 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 AC006455.6-201ENST00000426192 893 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 AC060234.3-201ENST00000430438 559 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 AL139275.1-201ENST00000447315 824 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 PEX5L-AS1-201ENST00000466064 827 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 PPP1R11P1-201ENST00000486095 376 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 AC109464.1-201ENST00000511091 819 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 AC139722.1-201ENST00000512502 782 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 MTND2P31-201ENST00000512602 616 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 IGKV2-4-201ENST00000523070 340 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 LINC01578-206ENST00000555520 977 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 AC010547.6-201ENST00000571789 193 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 AC087392.1-201ENST00000576252 820 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 AL359742.1-201ENST00000622497 540 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 AL512356.3-201ENST00000623005 461 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 AC091305.2-201ENST00000624049 1576 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 IPO5-229ENST00000631030 192 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 AC025428.2-201ENST00000435367 2672 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 LINC01951-201ENST00000377300 1925 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 TRPC4-207ENST00000426868 2709 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 VCAN-203ENST00000343200 9455 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 ST7-204ENST00000393444 2113 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 AC037459.2-201ENST00000514980 4076 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 MYRFL-201ENST00000299350 820 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 SDCBP-203ENST00000424270 1277 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.1 ms