Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 PTCD3-201ENST00000254630 6734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 PTPRB-208ENST00000550358 6583 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 TMEM167B-201ENST00000338272 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 ZNF345-202ENST00000420450 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 ECM2-202ENST00000375540 1606 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 MYOF-202ENST00000359263 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 IL6STP1-201ENST00000346911 1020 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 RNA5SP442-201ENST00000365050 107 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 IGHV2-5-201ENST00000390597 378 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 LINC02449-202ENST00000399866 517 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 AL096711.1-201ENST00000404780 554 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 BX470102.1-201ENST00000420695 531 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 AC008496.2-201ENST00000421252 460 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 AL157402.1-201ENST00000429469 363 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 AC105393.2-201ENST00000431911 549 ntTSL 4 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 PARD3-AS1-201ENST00000446211 302 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 AC009229.1-201ENST00000450854 622 ntTSL 4 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 AL157714.2-204ENST00000452283 973 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 VDAC2P4-201ENST00000452925 711 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 AP002345.1-201ENST00000456493 928 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 ALG13-214ENST00000482742 620 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 RPL7AP26-201ENST00000488538 813 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 LINC02024-202ENST00000493545 483 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 AC097263.1-201ENST00000496795 606 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 AC008592.1-201ENST00000503091 665 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 LINC01262-201ENST00000513681 879 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 IGHVII-49-1-201ENST00000521760 224 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 AC103831.1-201ENST00000522228 422 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 LINC02365-203ENST00000522554 802 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 RAB30-205ENST00000527633 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 NOP56P3-201ENST00000549457 385 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 AC025918.2-201ENST00000558683 763 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 AC138305.2-201ENST00000561595 556 ntTSL 4 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 NDUFA5P11-201ENST00000567995 343 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 MIR4789-201ENST00000577469 82 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 AC068254.1-201ENST00000584753 483 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 AL121989.1-201ENST00000585888 746 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 AC010327.4-201ENST00000585911 857 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 AC104365.1-202ENST00000587080 398 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 AC007786.1-202ENST00000590607 443 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 AL050403.2-202ENST00000603462 492 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 AC013244.1-201ENST00000604279 193 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 AP004372.1-201ENST00000604842 844 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 AC244100.4-201ENST00000617747 388 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 AL132796.3-201ENST00000624703 900 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 AC091953.4-201ENST00000625179 341 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 PCBP1-AS1-322ENST00000628147 553 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 NFATC3-202ENST00000346183 6040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 DRP2-205ENST00000541709 6835 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 MEF2C-232ENST00000629612 2851 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 EEF1A1P20-201ENST00000514852 1386 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 LDB2-216ENST00000515064 2295 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 CYP19A1-202ENST00000396404 2388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 FAM81B-201ENST00000283357 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 OAS2-207ENST00000620097 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 OR1L8-202ENST00000641027 2024 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 RBBP4-206ENST00000458695 1674 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 SLC9B1P1-201ENST00000331172 1337 ntBASIC7.02□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 SHC4-203ENST00000537958 1447 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SPOCK3Q9BQ16 AL031651.1-201ENST00000615357 1438 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SPOCK3Q9BQ16 CD101-201ENST00000256652 3283 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SPOCK3Q9BQ16 CCDC15-203ENST00000529051 3924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SPOCK3Q9BQ16 BRAFP1-201ENST00000445336 2703 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SPOCK3Q9BQ16 WDR87-201ENST00000303868 8847 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SPOCK3Q9BQ16 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SPOCK3Q9BQ16 PPP2R5C-205ENST00000445439 1526 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
SPOCK3Q9BQ16 CTNND1-212ENST00000525902 4984 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
SPOCK3Q9BQ16 CTNND1-214ENST00000526772 4966 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
SPOCK3Q9BQ16 CTNND1-236ENST00000533667 4990 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
SPOCK3Q9BQ16 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
SPOCK3Q9BQ16 FBXO11-202ENST00000403359 4055 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
SPOCK3Q9BQ16 FAH-204ENST00000539156 3427 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
SPOCK3Q9BQ16 PCDH18-202ENST00000412923 5102 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
SPOCK3Q9BQ16 IQGAP1-214ENST00000560738 3602 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SPOCK3Q9BQ16 AC093155.3-201ENST00000370548 2013 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SPOCK3Q9BQ16 OR51J1-201ENST00000332043 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SPOCK3Q9BQ16 C9orf92-202ENST00000380685 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SPOCK3Q9BQ16 MIR27A-201ENST00000385073 78 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SPOCK3Q9BQ16 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.2 ms