Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

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Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 AC003685.1-201ENST00000440430 466 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 AL049649.1-201ENST00000444792 1105 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 OR7E116P-201ENST00000448529 957 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 FO393408.1-201ENST00000458577 582 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 EIF1P7-201ENST00000487533 337 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 AC105460.2-202ENST00000502936 825 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 AC024558.1-201ENST00000505008 528 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 LINC01088-208ENST00000511895 795 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 SCARNA6.1-201ENST00000516989 238 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 CDC42P3-201ENST00000518493 633 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 LINC00589-202ENST00000518623 938 ntTSL 4 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 KCTD9P6-201ENST00000522306 950 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 NPM1P5-201ENST00000557228 838 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 AC068722.1-202ENST00000559600 655 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 TXNP4-201ENST00000575018 310 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 SUGT1P3-202ENST00000604259 383 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 SNORA35B-201ENST00000607417 129 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 AL445465.1-206ENST00000609544 528 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 OR11H2-202ENST00000641517 1085 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 PLEKHH2-201ENST00000282406 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 MEPE-209ENST00000560249 2206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 PLCE1-201ENST00000371375 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 RXFP1-211ENST00000613319 3771 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 TCF12-214ENST00000559710 1314 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 TM4SF20-201ENST00000304568 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 LINC01297-204ENST00000621052 4222 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 ANKRD12-203ENST00000400020 9115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 SYTL2-208ENST00000524452 2733 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 AC007114.2-201ENST00000576014 4281 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 THAP6-201ENST00000311638 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 CLEC6A-201ENST00000382073 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 AC093297.3-201ENST00000607056 2517 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 DEFB127-201ENST00000382388 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
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CCDC93Q567U6 RPL35AP24-201ENST00000413846 330 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
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CCDC93Q567U6 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 LINC00939-201ENST00000502479 4972 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 MDM4-216ENST00000616250 9597 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 HMGA1P8-201ENST00000414130 321 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 AC099654.1-202ENST00000415836 564 ntTSL 4 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 LINC01820-201ENST00000418415 570 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 TMEM196-203ENST00000422233 775 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 SETP9-201ENST00000423837 832 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 AL359853.3-201ENST00000423879 544 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 AL122019.1-201ENST00000438575 798 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 AL450996.1-201ENST00000445574 1202 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 OR52Y1P-201ENST00000452418 828 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 AL022329.1-203ENST00000453811 451 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 AC026347.1-201ENST00000463255 474 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 RPL7P39-201ENST00000481157 744 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 AC108941.2-201ENST00000506796 716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 AC084871.1-201ENST00000508020 628 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 AC091819.2-201ENST00000522292 490 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 AC025366.1-201ENST00000523264 202 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 OR4A42P-201ENST00000531397 938 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
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