Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 EPPIN-202ENST00000354280 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 AP002001.1-201ENST00000526101 1759 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 SMARCA2-206ENST00000382185 1584 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 LINC00615-201ENST00000546725 1406 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 OR5B12-201ENST00000302572 1054 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 RIMKLBP2-201ENST00000424737 654 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 AC126120.1-201ENST00000431082 470 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 AC069154.1-201ENST00000432914 542 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 TCEA1P3-201ENST00000443005 880 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 MIS18A-AS1-201ENST00000453549 769 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 AC080162.1-201ENST00000480764 491 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 TRBV8-1-201ENST00000481590 279 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 AC005823.2-201ENST00000505978 650 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 AC021106.1-201ENST00000509020 1058 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 AC010451.1-201ENST00000509057 556 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 BAALC-AS1-205ENST00000521102 613 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 AC091819.2-201ENST00000522292 490 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 AC124067.3-201ENST00000522643 847 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 AP003037.1-201ENST00000537594 267 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 ETFRF1-211ENST00000557540 1259 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 AC009167.1-201ENST00000568317 579 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 AC136443.4-201ENST00000568759 579 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 AP001011.1-201ENST00000583546 690 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 ZNF486-202ENST00000597083 734 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 AP003400.2-201ENST00000624036 666 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 LINC01955-201ENST00000626392 792 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 SLC17A4-202ENST00000397076 2331 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 AADAT-202ENST00000353187 2101 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 ZNF568-214ENST00000616085 3542 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 AL360014.1-201ENST00000562922 2084 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 CRYGS-201ENST00000307944 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 OR4S2-201ENST00000312422 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 BPY2-201ENST00000331070 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 BPY2C-201ENST00000382287 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 BPY2B-201ENST00000382392 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 DSCR4-IT1-201ENST00000417138 424 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 LINC02532-206ENST00000433965 570 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 C1orf140-201ENST00000434398 645 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 AC079117.1-201ENST00000445178 1000 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 AL354793.1-201ENST00000446028 713 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 AC005518.1-201ENST00000448131 1116 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 AZGP1P2-201ENST00000454506 345 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 AC073486.1-202ENST00000458437 489 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 AP002884.1-201ENST00000479691 655 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 PLGLA-202ENST00000482249 475 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 AC025458.1-201ENST00000506046 166 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 AC139720.1-201ENST00000509497 512 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 AC239584.1-201ENST00000510419 732 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 AC012055.1-201ENST00000511346 1144 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 LINC01033-204ENST00000523194 715 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 AC027369.2-201ENST00000528030 440 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 OR5AM1P-201ENST00000532136 1032 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 LINC02451-202ENST00000548764 579 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 AL133371.1-201ENST00000555481 764 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 C14orf2-211ENST00000557040 472 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 AC009087.1-201ENST00000561827 369 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 AC136944.1-201ENST00000567464 560 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 LINC00556-201ENST00000569603 412 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 ZNF235-204ENST00000589799 955 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 AC092070.2-201ENST00000597550 545 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 FAM27E4-201ENST00000605259 342 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 AC073593.1-201ENST00000624500 411 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 AC092329.4-204ENST00000639327 549 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 RFC1-217ENST00000639695 867 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 KIAA1328-202ENST00000586135 1863 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
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