Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 AL603865.2-201ENST00000401679 213 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SP140Q13342 MRPL35-203ENST00000409180 651 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SP140Q13342 MIR4435-2HG-203ENST00000409569 514 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
SP140Q13342 AL445213.1-201ENST00000412589 747 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SP140Q13342 AL603962.1-201ENST00000413148 436 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SP140Q13342 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SP140Q13342 ICA1L-206ENST00000418208 602 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SP140Q13342 RPS17P17-201ENST00000419392 409 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SP140Q13342 LINC01031-201ENST00000420807 779 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SP140Q13342 AL031846.1-202ENST00000424436 592 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SP140Q13342 QKI-206ENST00000424802 954 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
SP140Q13342 LINC01435-201ENST00000425050 722 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SP140Q13342 TMEM246-AS1-202ENST00000425734 466 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SP140Q13342 AC093151.2-201ENST00000429109 394 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SP140Q13342 MTCYBP29-201ENST00000436327 1006 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SP140Q13342 AL356121.1-201ENST00000442911 156 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SP140Q13342 AC079922.1-201ENST00000443291 359 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SP140Q13342 AC245291.3-201ENST00000443400 292 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SP140Q13342 OR2L9P-201ENST00000444456 913 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SP140Q13342 COX4I1P2-201ENST00000447446 547 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SP140Q13342 LRRC69-202ENST00000448384 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SP140Q13342 AC011625.1-201ENST00000455442 526 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SP140Q13342 RANP2-201ENST00000456833 229 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SP140Q13342 LNCSRLR-201ENST00000490375 709 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SP140Q13342 SOX2-OT-216ENST00000497122 578 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SP140Q13342 AC096576.3-201ENST00000505528 721 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SP140Q13342 AC097478.1-204ENST00000509723 547 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SP140Q13342 AB015752.1-201ENST00000521975 578 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SP140Q13342 AC090115.2-201ENST00000548060 883 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SP140Q13342 AC025031.1-201ENST00000552634 562 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SP140Q13342 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SP140Q13342 AC009558.2-201ENST00000558258 396 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SP140Q13342 AC084757.2-201ENST00000559165 540 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SP140Q13342 MIR5010-201ENST00000582846 120 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SP140Q13342 VDAC1P8-204ENST00000589489 997 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SP140Q13342 PCNAP1-202ENST00000595299 752 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SP140Q13342 AL589765.6-201ENST00000601909 549 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SP140Q13342 AC008536.1-201ENST00000602872 669 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SP140Q13342 AC092954.1-201ENST00000609121 445 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SP140Q13342 AL138960.1-201ENST00000613838 513 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SP140Q13342 VN1R9P-201ENST00000614184 867 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SP140Q13342 AL391095.2-201ENST00000615228 378 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SP140Q13342 AC011346.1-204ENST00000638089 1210 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SP140Q13342 OR4A15-202ENST00000641526 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SP140Q13342 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
SP140Q13342 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
SP140Q13342 POT1-202ENST00000393329 3950 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
SP140Q13342 TMEM161B-211ENST00000512429 1796 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.43
SP140Q13342 ZNF607-202ENST00000395835 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.43
SP140Q13342 GHR-211ENST00000618088 4491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
SP140Q13342 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
SP140Q13342 OFD1P15Y-201ENST00000411536 1392 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
SP140Q13342 SAMM50P1-201ENST00000455403 1399 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
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SP140Q13342 HGF-202ENST00000354224 1425 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
SP140Q13342 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
SP140Q13342 NEDD9-202ENST00000379446 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
SP140Q13342 FAT4-202ENST00000394329 16123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SP140Q13342 EOGT-208ENST00000540764 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
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SP140Q13342 TMEM67-205ENST00000453321 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
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SP140Q13342 AL158832.1-201ENST00000429661 406 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
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SP140Q13342 AC064862.5-201ENST00000440618 334 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SP140Q13342 POU5F1P5-201ENST00000445059 658 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SP140Q13342 AL445238.1-201ENST00000450029 712 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SP140Q13342 RPS27AP3-201ENST00000453803 454 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
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SP140Q13342 RPSAP39-201ENST00000467439 883 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SP140Q13342 UCK2-205ENST00000469256 753 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SP140Q13342 MARK2P8-201ENST00000476069 952 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SP140Q13342 RPL12P31-201ENST00000478433 450 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SP140Q13342 SNRPCP11-201ENST00000492453 205 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SP140Q13342 LINC02325-201ENST00000499910 1115 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
SP140Q13342 AC114956.1-201ENST00000504277 512 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SP140Q13342 LINC01386-201ENST00000506196 440 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SP140Q13342 OR4D12P-201ENST00000509361 911 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SP140Q13342 HPRT1P1-201ENST00000509498 657 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SP140Q13342 AC021146.7-201ENST00000509604 775 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SP140Q13342 AC147055.3-201ENST00000510547 851 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SP140Q13342 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
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