Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 PSG9-202ENST00000270077 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 SYTL2-208ENST00000524452 2733 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 ITGB3BP-201ENST00000271002 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 RNA5SP242-201ENST00000364171 118 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 RPL34-203ENST00000394668 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 AC005323.2-201ENST00000399342 583 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 HNRNPA1P29-201ENST00000426409 879 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 RPL7P56-201ENST00000429441 717 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 TEX41-206ENST00000432608 661 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 LINC02094-201ENST00000437646 520 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 AC019185.1-201ENST00000442718 389 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 IGBP1P3-201ENST00000447449 1000 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 RN7SL717P-201ENST00000478343 297 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 RABGAP1L-214ENST00000478442 648 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 AC111000.6-201ENST00000514471 709 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 AP003086.3-201ENST00000527030 365 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 AC125494.2-201ENST00000602431 657 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 AC004477.3-201ENST00000614061 590 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 LINC01320-210ENST00000626008 929 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 BX284613.1-201ENST00000452221 1641 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 HNMT-203ENST00000329366 835 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 SPINK14-201ENST00000356972 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 RN7SKP6-201ENST00000364795 319 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 U3.28-201ENST00000391249 210 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 OR2A25-201ENST00000408898 1014 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 LINC02518-201ENST00000421737 524 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 RIMKLBP2-201ENST00000424737 654 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 AL807757.1-201ENST00000437846 424 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
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FOXF1Q12946 AL391987.1-201ENST00000441025 200 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 AL358876.1-201ENST00000453364 1075 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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FOXF1Q12946 AC023141.9-201ENST00000458734 412 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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FOXF1Q12946 AC140125.1-201ENST00000515739 684 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 RN7SKP99-201ENST00000517028 307 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 IGLVIV-64-201ENST00000518581 301 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 SPINK14-202ENST00000562793 157 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 AC009019.1-203ENST00000568603 515 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 AC139099.1-201ENST00000573737 976 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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FOXF1Q12946 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 DARS-AS1-225ENST00000615163 824 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 AC005618.4-201ENST00000625053 554 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 AL355860.1-201ENST00000636087 1229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 CPA3-201ENST00000296046 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 DLGAP1-AS2-202ENST00000573177 1388 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 GKN2-202ENST00000481498 1498 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 LGALS8-222ENST00000527974 1349 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 CCDC178-209ENST00000579947 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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