Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 TPMT-201ENST00000309983 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
APOBRQ0VD83 CLEC9A-201ENST00000355819 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
APOBRQ0VD83 MS4A7-211ENST00000534016 1378 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
APOBRQ0VD83 EPS15-203ENST00000371733 5225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
APOBRQ0VD83 CCDC129-211ENST00000615280 4142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
APOBRQ0VD83 NCAPG2-202ENST00000409339 5253 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
APOBRQ0VD83 ZNF675-201ENST00000359788 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
APOBRQ0VD83 THRB-IT1-201ENST00000425296 1754 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
APOBRQ0VD83 SNX18P3-202ENST00000565670 1750 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
APOBRQ0VD83 POT1-202ENST00000393329 3950 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
APOBRQ0VD83 YES1-203ENST00000577961 4554 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
APOBRQ0VD83 LINC00939-201ENST00000502479 4972 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
APOBRQ0VD83 OR4K5-201ENST00000315915 1078 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
APOBRQ0VD83 SCGB1D4-201ENST00000358585 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
APOBRQ0VD83 PLG-203ENST00000366924 1166 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
APOBRQ0VD83 U6.112-201ENST00000384129 70 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
APOBRQ0VD83 SNORD116-12-201ENST00000384468 92 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
APOBRQ0VD83 AL445238.1-204ENST00000400311 463 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
APOBRQ0VD83 UBE2V1P14-201ENST00000415815 558 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
APOBRQ0VD83 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
APOBRQ0VD83 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
APOBRQ0VD83 AL445465.1-208ENST00000419709 506 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
APOBRQ0VD83 OXSM-202ENST00000420173 1256 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
APOBRQ0VD83 AL160275.1-201ENST00000423632 476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
APOBRQ0VD83 SDCBP-203ENST00000424270 1277 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
APOBRQ0VD83 E2F3-IT1-201ENST00000433182 400 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
APOBRQ0VD83 AL035701.1-202ENST00000437249 371 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
APOBRQ0VD83 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
APOBRQ0VD83 PIK3IP1-AS1-201ENST00000440456 554 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
APOBRQ0VD83 CST12P-201ENST00000457644 362 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
APOBRQ0VD83 CTSLP6-201ENST00000458273 1002 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
APOBRQ0VD83 AC104339.1-201ENST00000465478 348 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
APOBRQ0VD83 AL157777.1-201ENST00000468100 304 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
APOBRQ0VD83 RN7SL165P-201ENST00000477476 291 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
APOBRQ0VD83 GM2AP2-201ENST00000491764 562 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
APOBRQ0VD83 CRISP1-203ENST00000505118 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
APOBRQ0VD83 AC108866.1-204ENST00000508362 558 ntTSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.22
APOBRQ0VD83 MTND1P22-201ENST00000510572 951 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
APOBRQ0VD83 AC087897.1-201ENST00000550134 156 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
APOBRQ0VD83 AC009120.3-201ENST00000563335 499 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
APOBRQ0VD83 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
APOBRQ0VD83 RN7SL622P-201ENST00000585292 275 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
APOBRQ0VD83 AC099811.4-201ENST00000592536 496 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
APOBRQ0VD83 AL589863.1-201ENST00000595383 631 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
APOBRQ0VD83 AC243960.3-202ENST00000599770 594 ntTSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.22
APOBRQ0VD83 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
APOBRQ0VD83 WBP1LP12-201ENST00000604449 331 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
APOBRQ0VD83 SUMO2P14-201ENST00000604488 293 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
APOBRQ0VD83 MIR7109-201ENST00000613748 65 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
APOBRQ0VD83 uc_338.29-201ENST00000615099 168 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
APOBRQ0VD83 LINC00284-211ENST00000620454 534 ntTSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.22
APOBRQ0VD83 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
APOBRQ0VD83 DRG1-207ENST00000629688 309 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
APOBRQ0VD83 SATB1-AS1-263ENST00000630022 622 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
APOBRQ0VD83 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
APOBRQ0VD83 STON1-202ENST00000406226 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
APOBRQ0VD83 RPL37-201ENST00000274242 7686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
APOBRQ0VD83 RAB30-214ENST00000534141 3746 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
APOBRQ0VD83 FAM197Y2-202ENST00000448006 2338 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
APOBRQ0VD83 TNFSF11-202ENST00000358545 1520 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
APOBRQ0VD83 AP003486.1-201ENST00000525716 3994 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
APOBRQ0VD83 MEIOC-202ENST00000409464 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
APOBRQ0VD83 SPAG9-209ENST00000510283 4949 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
APOBRQ0VD83 HMBOX1-206ENST00000519047 1551 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
APOBRQ0VD83 MAPK10-270ENST00000641102 3538 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
APOBRQ0VD83 HOXD8-202ENST00000429017 1608 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
APOBRQ0VD83 SNX13-213ENST00000611725 6817 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
APOBRQ0VD83 VEPH1-205ENST00000468233 1401 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
APOBRQ0VD83 AL158064.2-205ENST00000640346 4082 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
APOBRQ0VD83 CLDN10-201ENST00000299339 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
APOBRQ0VD83 SDHAF3-201ENST00000360382 731 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
APOBRQ0VD83 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
APOBRQ0VD83 AL451142.1-201ENST00000375867 775 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
APOBRQ0VD83 EEF1AKMT1-201ENST00000382754 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
APOBRQ0VD83 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
APOBRQ0VD83 NUTM2A-AS1-203ENST00000413961 501 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
APOBRQ0VD83 AC007568.1-201ENST00000422912 471 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
APOBRQ0VD83 GPN3P1-201ENST00000423883 535 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
APOBRQ0VD83 QKI-206ENST00000424802 954 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
APOBRQ0VD83 AL121902.1-201ENST00000426963 459 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
APOBRQ0VD83 AL606534.4-201ENST00000427176 792 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
APOBRQ0VD83 AC093151.2-201ENST00000429109 394 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
APOBRQ0VD83 LINC01745-201ENST00000430921 372 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
APOBRQ0VD83 RPSAP32-201ENST00000432681 526 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
APOBRQ0VD83 AC016582.1-203ENST00000433142 502 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
APOBRQ0VD83 AL021937.4-201ENST00000444848 444 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
APOBRQ0VD83 LINC00867-203ENST00000445161 580 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
APOBRQ0VD83 AL589880.1-201ENST00000448271 287 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
APOBRQ0VD83 RN7SL39P-201ENST00000462264 297 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
APOBRQ0VD83 UCK2-205ENST00000469256 753 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
APOBRQ0VD83 AC112206.2-204ENST00000504068 793 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
APOBRQ0VD83 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
APOBRQ0VD83 B4GALNT2P1-201ENST00000508857 307 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
APOBRQ0VD83 AC022784.4-201ENST00000518589 422 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
APOBRQ0VD83 CHCHD7-210ENST00000521524 703 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
APOBRQ0VD83 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
APOBRQ0VD83 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
APOBRQ0VD83 OR8I1P-201ENST00000529291 931 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
APOBRQ0VD83 AC009729.1-201ENST00000548873 1133 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
APOBRQ0VD83 GPATCH2L-203ENST00000553588 776 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
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