Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 HHLA1-201ENST00000414222 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 LNX2-201ENST00000316334 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AC011416.1-201ENST00000514947 1732 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 ANKRD12-203ENST00000400020 9115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 CDKL4-201ENST00000378803 1567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 TRPC1-205ENST00000612385 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 BABAM2-206ENST00000379632 1752 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 SLC16A6-201ENST00000327268 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 POU1F1-201ENST00000344265 1149 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AC098592.2-201ENST00000413158 265 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 SEPT7P8-201ENST00000413308 775 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 SOS1-IT1-201ENST00000420644 539 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 LINC02523-201ENST00000423208 2963 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AC137630.2-202ENST00000429681 555 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AL512661.1-201ENST00000434586 1253 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AC019117.1-202ENST00000439046 589 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 RRM2P4-201ENST00000441721 562 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AL512605.1-202ENST00000441919 381 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AL359955.2-201ENST00000445380 353 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 LINC01952-202ENST00000450016 281 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 YWHAEP1-201ENST00000453697 763 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AC092824.1-201ENST00000483524 576 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 CASC21-201ENST00000521586 290 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 LINC01609-202ENST00000522778 566 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 TMEM68-214ENST00000523073 536 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AP003086.3-201ENST00000527030 365 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AC027544.3-201ENST00000535082 757 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AC009509.1-201ENST00000536317 1110 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AP000851.1-202ENST00000542119 743 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 PARPBP-212ENST00000543784 992 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AC051619.2-201ENST00000559063 397 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AP001007.3-201ENST00000560744 356 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AC092078.2-201ENST00000560900 581 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 SLC25A3P1-203ENST00000563752 460 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 MTATP6P24-201ENST00000576835 677 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AC145207.6-201ENST00000579981 782 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AC008543.4-201ENST00000585694 442 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 ZNF738-205ENST00000597810 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AC013244.1-201ENST00000604279 193 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AL645933.2-201ENST00000606743 1207 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AL121652.1-201ENST00000608851 448 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AL096803.3-201ENST00000609032 532 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AC022106.1-201ENST00000612834 766 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 RN7SL787P-201ENST00000613000 284 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AL391095.2-201ENST00000615228 378 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AC007275.1-201ENST00000621243 671 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AL136228.1-201ENST00000622221 319 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 C8orf89-202ENST00000624510 658 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AC084816.1-204ENST00000628326 631 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 NLGN1-202ENST00000401917 1827 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 TRIQK-211ENST00000520430 1829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 CLEC4E-201ENST00000299663 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AC093297.3-201ENST00000607056 2517 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 IPO8-209ENST00000544829 3212 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 CD200R1-201ENST00000295863 1692 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 EIF5AL1-201ENST00000520547 3840 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 CASC11-201ENST00000502463 3301 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AP002004.1-201ENST00000532510 3530 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 EMSY-201ENST00000334736 5508 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 CDC7-201ENST00000234626 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 PGM3-215ENST00000616566 5905 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 CCDC190-202ENST00000367911 1395 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 RAB3B-201ENST00000371655 12844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 IGF2BP3-218ENST00000619562 2126 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 CC2D2B-202ENST00000410012 1792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 OR13C1P-202ENST00000641378 2919 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 NBEA-207ENST00000537702 4089 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 RBPJP7-201ENST00000442803 1447 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 RBPJP5-201ENST00000449433 1447 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 CNIH1-201ENST00000216416 4793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 MRPS36-201ENST00000256441 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 REP15-201ENST00000310791 1078 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 TMSB4XP2-201ENST00000335179 210 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 TFPI-202ENST00000339091 1088 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 RNA5SP478-201ENST00000364657 115 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 SMARCA2-207ENST00000382186 955 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 TRAV25-201ENST00000390454 403 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 U3.25-201ENST00000391209 220 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 METTL5-205ENST00000409837 936 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 U3.43-201ENST00000410734 213 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AC245060.4-201ENST00000413293 1121 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AL513325.1-201ENST00000417716 1034 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 ARL2BPP3-201ENST00000421226 480 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AL031429.1-201ENST00000426775 749 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 HMGB3P5-201ENST00000428894 612 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AK3P5-201ENST00000432033 519 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 GAPDHP75-201ENST00000433910 943 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 KRTAP8-2P-201ENST00000440620 186 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99 ms