Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 CCL4L2-217ENST00000620250 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 AL357153.4-201ENST00000620487 1016 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 HSPD1P7-201ENST00000447985 1686 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 UGT2A2-202ENST00000604629 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 RNF19BPY-201ENST00000458209 1550 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 NUF2-202ENST00000367900 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 MATR3-215ENST00000510056 3040 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 SMARCA2-207ENST00000382186 955 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 RNA5SP122-201ENST00000384457 108 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 AL031985.1-201ENST00000392713 418 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 AC017048.1-201ENST00000412153 495 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 CDY17P-201ENST00000414121 1282 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 DSCR4-IT1-201ENST00000417138 424 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 LINC01203-201ENST00000419566 580 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 AL158817.1-201ENST00000422310 933 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 AC000095.2-201ENST00000424407 768 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 LINC01798-204ENST00000433396 682 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 AC006335.2-201ENST00000437993 330 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 AC002504.1-201ENST00000438281 691 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 SUMO2P3-201ENST00000438311 288 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 LINC01880-201ENST00000446593 561 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 AC073072.2-201ENST00000447425 348 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 LINC01456-201ENST00000453902 708 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 PPIAP19-201ENST00000486414 492 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 AC010445.1-201ENST00000507674 440 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 TMEM97P2-201ENST00000517841 403 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 MINCR-206ENST00000524335 499 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 PIWIL4-203ENST00000537419 831 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 AC135626.1-201ENST00000556983 435 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 AC137800.1-201ENST00000562976 573 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 AC211433.1-206ENST00000595409 733 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 AL353729.2-201ENST00000605859 1249 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 Metazoa_SRP.130-201ENST00000622625 267 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 AP003072.5-201ENST00000623872 773 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 AC079776.5-201ENST00000641920 211 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 KLRC4-KLRK1-201ENST00000539300 1507 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 AC005703.1-201ENST00000431343 1773 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 URI1-201ENST00000360605 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 CNGA1-202ENST00000402813 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 SAMM50P1-201ENST00000455403 1399 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 GAPDHP24-201ENST00000328713 983 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 BX119904.3-201ENST00000428194 957 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 RPL36AP39-201ENST00000445859 318 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 TAS2R39-201ENST00000446620 1017 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 HMGN1P36-201ENST00000446623 298 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 AC019117.1-204ENST00000451792 442 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 LDHBP2-201ENST00000456969 1005 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 AC007003.1-201ENST00000472463 736 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 RPL12P24-201ENST00000474907 486 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 AC068672.3-203ENST00000505166 311 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 AC138866.2-201ENST00000508650 584 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 CENPK-210ENST00000510354 1124 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 UGT2A3P7-201ENST00000510485 734 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 AC097486.1-201ENST00000515331 210 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 RN7SKP253-201ENST00000516424 309 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 165.2 ms