Protein–RNA interactions for Protein: P19838

NFKB1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB1P19838 PWRN1-212ENST00000569908 1435 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 HMG20A-202ENST00000381714 4112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 IBTK-201ENST00000306270 6054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 ACSL5-203ENST00000356116 3353 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 CTNND1-216ENST00000527467 5071 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 CTNND1-229ENST00000531014 5053 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 ADGRL3-207ENST00000507625 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 AC010132.2-201ENST00000295493 1043 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 OR9G4-201ENST00000302957 984 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 IMPA1-202ENST00000311489 1106 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 RN7SKP107-201ENST00000364157 290 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 NHP2P2-201ENST00000396362 460 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 RPSAP44-201ENST00000406712 884 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 SNX18P13-201ENST00000412442 529 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 AC009237.5-201ENST00000414271 501 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 RBMY2JP-201ENST00000425544 1059 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 VDAC2P3-201ENST00000430995 828 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 LINC01291-203ENST00000435984 565 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 LINC00570-203ENST00000437795 490 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 AC098824.1-201ENST00000453565 980 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 AL672167.3-201ENST00000465951 960 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 AC115223.1-201ENST00000466377 870 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 AC021074.2-201ENST00000468434 172 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 RN7SL392P-201ENST00000473024 299 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 APOPT1-204ENST00000473127 739 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 AC107021.1-202ENST00000480247 555 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 EIF4E2P2-201ENST00000492033 736 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 AC112225.1-201ENST00000508230 297 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 AC092436.4-201ENST00000510905 483 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 AC226119.1-201ENST00000514073 682 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 Vault.2-201ENST00000516519 98 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 AP001257.1-201ENST00000533106 385 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 FAXC-204ENST00000538471 941 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 AP003721.1-201ENST00000543907 864 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 AC092747.2-201ENST00000545069 983 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 LINC02416-201ENST00000550019 540 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 AC020891.2-201ENST00000559672 776 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 AC007496.1-201ENST00000565641 739 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 MIR3135A-201ENST00000578460 77 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 SLC14A2-AS1-203ENST00000592286 528 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 AL136164.2-201ENST00000602823 732 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 AC104184.1-201ENST00000607513 721 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 AC093635.1-201ENST00000609028 555 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 LRMDA-216ENST00000611306 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 AL137789.1-204ENST00000623503 666 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 AC110079.2-202ENST00000629093 698 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 AC183089.2-201ENST00000637931 916 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 BEST1-202ENST00000449131 4267 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 ECM2-202ENST00000375540 1606 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 MID1-205ENST00000380785 6092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 PSG1-203ENST00000403380 1722 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 EPS15P1-202ENST00000459691 2071 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 S100Z-201ENST00000317593 1468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 OR12D2-207ENST00000642051 1496 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 DRP2-204ENST00000538510 6852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 NBPF8-201ENST00000583271 5330 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 GNE-205ENST00000539815 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 AKR1C2-201ENST00000380753 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 NUP43-201ENST00000340413 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 ZNF812P-201ENST00000457674 1694 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 AL365204.1-201ENST00000423440 1430 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 AL121949.2-201ENST00000403446 1548 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 GTF2H3-212ENST00000543341 3329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 ADAL-202ENST00000422466 3767 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 KLRD1-203ENST00000350274 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 TTR-201ENST00000237014 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 BANF2-201ENST00000246090 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 RNA5SP472-201ENST00000363868 119 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 OR1N2-201ENST00000373688 1103 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 CFAP70-204ENST00000394865 1222 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 NCSTNP1-201ENST00000406229 144 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 RN7SKP236-201ENST00000410635 284 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 RPL17P17-201ENST00000419491 557 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 AC118470.1-201ENST00000419891 453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 AL022100.2-201ENST00000422548 389 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 AL357314.1-201ENST00000433521 806 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 AC097499.1-201ENST00000444277 208 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 FREM2-AS1-201ENST00000448887 465 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 RPSAP7-201ENST00000456871 885 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 RN7SL325P-201ENST00000460434 283 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 AC018475.1-201ENST00000478358 465 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 CFLAR-223ENST00000479953 1230 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 RN7SL797P-201ENST00000486314 297 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 RN7SL775P-201ENST00000498361 336 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.2 ms