Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

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Length 936 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 AL121594.5-201ENST00000631724 573 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
ZNRF3Q9ULT6 DUXB-201ENST00000633875 1079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
ZNRF3Q9ULT6 STXBP5-203ENST00000367480 3297 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
ZNRF3Q9ULT6 BEST3-202ENST00000330891 3532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
ZNRF3Q9ULT6 ZBED3-AS1-216ENST00000515356 1987 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
ZNRF3Q9ULT6 WDR95P-201ENST00000425638 1542 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
ZNRF3Q9ULT6 ARID5B-201ENST00000279873 7891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
ZNRF3Q9ULT6 LINC00649-203ENST00000427447 9124 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
ZNRF3Q9ULT6 ANKRD31-203ENST00000506364 6207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
ZNRF3Q9ULT6 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
ZNRF3Q9ULT6 GABRA3-204ENST00000535043 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
ZNRF3Q9ULT6 ZNF112-201ENST00000337401 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
ZNRF3Q9ULT6 INTS12-202ENST00000394735 1927 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
ZNRF3Q9ULT6 ZNF181-204ENST00000492450 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
ZNRF3Q9ULT6 MEF2C-201ENST00000340208 6192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
ZNRF3Q9ULT6 IFNE-201ENST00000448696 1475 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
ZNRF3Q9ULT6 AC092111.1-201ENST00000618256 3358 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
ZNRF3Q9ULT6 RABGAP1L-203ENST00000347255 1744 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
ZNRF3Q9ULT6 NEPNP-201ENST00000404786 1371 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
ZNRF3Q9ULT6 USP50-203ENST00000532404 1386 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
ZNRF3Q9ULT6 ZNF214-204ENST00000536068 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
ZNRF3Q9ULT6 BRWD1-203ENST00000342449 12929 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
ZNRF3Q9ULT6 MAPK10-251ENST00000640858 3052 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
ZNRF3Q9ULT6 ZNF630-202ENST00000409324 2455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
ZNRF3Q9ULT6 OR11G2-203ENST00000641879 4415 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
ZNRF3Q9ULT6 CSN1S1-201ENST00000246891 985 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
ZNRF3Q9ULT6 MTHFD2P5-201ENST00000320415 844 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
ZNRF3Q9ULT6 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
ZNRF3Q9ULT6 SYCP3-202ENST00000392924 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
ZNRF3Q9ULT6 AL603865.2-201ENST00000401679 213 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
ZNRF3Q9ULT6 HNRNPDP2-201ENST00000406475 478 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
ZNRF3Q9ULT6 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
ZNRF3Q9ULT6 LINC00161-201ENST00000412526 870 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
ZNRF3Q9ULT6 AL449283.1-202ENST00000418249 604 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
ZNRF3Q9ULT6 BBIP1-203ENST00000423273 492 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
ZNRF3Q9ULT6 BX119904.4-201ENST00000424402 301 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
ZNRF3Q9ULT6 AL513329.1-201ENST00000426575 657 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
ZNRF3Q9ULT6 AC108051.1-201ENST00000435291 549 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
ZNRF3Q9ULT6 OR5H14-201ENST00000437310 1080 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
ZNRF3Q9ULT6 AL133329.1-201ENST00000437466 478 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
ZNRF3Q9ULT6 PCBP1-AS1-232ENST00000442040 1111 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
ZNRF3Q9ULT6 AL442224.1-201ENST00000443771 391 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
ZNRF3Q9ULT6 BBIP1-206ENST00000447005 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
ZNRF3Q9ULT6 SNX18P26-201ENST00000458433 740 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
ZNRF3Q9ULT6 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
ZNRF3Q9ULT6 AC008696.2-201ENST00000503323 825 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
ZNRF3Q9ULT6 AF250324.1-203ENST00000508156 517 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
ZNRF3Q9ULT6 AC109464.1-201ENST00000511091 819 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
ZNRF3Q9ULT6 OSGEPL1-AS1-203ENST00000523895 567 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
ZNRF3Q9ULT6 DDHD2-219ENST00000529845 945 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
ZNRF3Q9ULT6 RNASE9-204ENST00000553541 1136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
ZNRF3Q9ULT6 LINC01579-205ENST00000556447 791 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
ZNRF3Q9ULT6 AC018557.2-201ENST00000565082 536 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
ZNRF3Q9ULT6 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
ZNRF3Q9ULT6 AP005120.1-202ENST00000584321 506 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
ZNRF3Q9ULT6 AL645933.2-201ENST00000606743 1207 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
ZNRF3Q9ULT6 AC015922.4-201ENST00000612568 690 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
ZNRF3Q9ULT6 AP002782.1-201ENST00000623107 614 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
ZNRF3Q9ULT6 MAPKBP1-217ENST00000627631 210 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
ZNRF3Q9ULT6 LGI1-209ENST00000627699 664 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
ZNRF3Q9ULT6 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
ZNRF3Q9ULT6 PPP2R5C-205ENST00000445439 1526 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
ZNRF3Q9ULT6 NBPF12-205ENST00000617614 4630 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
ZNRF3Q9ULT6 PLCB4-202ENST00000378473 5619 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
ZNRF3Q9ULT6 AL359715.4-201ENST00000606629 1436 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
ZNRF3Q9ULT6 C1QTNF7-201ENST00000295297 4516 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
ZNRF3Q9ULT6 HEMGN-201ENST00000259456 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
ZNRF3Q9ULT6 AC010328.1-201ENST00000596769 4060 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
ZNRF3Q9ULT6 ZNF292-202ENST00000369577 10610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
ZNRF3Q9ULT6 SYTL5-202ENST00000456733 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
ZNRF3Q9ULT6 UGT2B24P-201ENST00000514441 1597 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
ZNRF3Q9ULT6 GCNA-201ENST00000373695 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
ZNRF3Q9ULT6 PDE4DIP-206ENST00000369356 8307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
ZNRF3Q9ULT6 MEF2C-244ENST00000636998 5936 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
ZNRF3Q9ULT6 HSPD1P11-201ENST00000508643 1702 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
ZNRF3Q9ULT6 AL596244.1-201ENST00000567068 3779 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
ZNRF3Q9ULT6 CAPS2-205ENST00000409445 2135 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
ZNRF3Q9ULT6 TRIM5-203ENST00000396847 3170 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
ZNRF3Q9ULT6 LINC02153-202ENST00000522604 1644 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
ZNRF3Q9ULT6 AC007744.1-201ENST00000607540 2289 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
ZNRF3Q9ULT6 POLA1-201ENST00000379059 5440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
ZNRF3Q9ULT6 POLA1-206ENST00000611764 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
ZNRF3Q9ULT6 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
ZNRF3Q9ULT6 NBPF12-203ENST00000611443 5594 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
ZNRF3Q9ULT6 FMN1-211ENST00000561249 4251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
ZNRF3Q9ULT6 NRXN1-211ENST00000406859 2553 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
ZNRF3Q9ULT6 TRIM6-TRIM34-201ENST00000354852 3391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
ZNRF3Q9ULT6 LCP1-202ENST00000398576 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
ZNRF3Q9ULT6 LINC02086-202ENST00000492522 2091 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
ZNRF3Q9ULT6 BPY2-201ENST00000331070 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
ZNRF3Q9ULT6 RNU6-252P-201ENST00000363232 107 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
ZNRF3Q9ULT6 BPY2C-201ENST00000382287 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
ZNRF3Q9ULT6 BPY2B-201ENST00000382392 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
ZNRF3Q9ULT6 TRDC-201ENST00000390477 720 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
ZNRF3Q9ULT6 HMGB1P10-201ENST00000395823 563 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
ZNRF3Q9ULT6 UBE2V1P11-201ENST00000411559 285 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
ZNRF3Q9ULT6 AC093155.2-201ENST00000420734 937 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
ZNRF3Q9ULT6 AL390115.1-201ENST00000425271 423 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
ZNRF3Q9ULT6 AL022337.1-201ENST00000434510 357 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
ZNRF3Q9ULT6 AC019117.1-202ENST00000439046 589 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
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