Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 LINC02000-201ENST00000483245 640 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 AC124893.1-201ENST00000496247 545 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 CCDC11P1-201ENST00000503137 1162 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 LINC02430-201ENST00000504755 476 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 AC006296.2-201ENST00000507932 764 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 AF250324.1-203ENST00000508156 517 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 LINC01017-201ENST00000508823 768 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 AC106864.1-201ENST00000510655 640 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 GAPDHP71-201ENST00000511530 1003 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 RNU6-1102P-201ENST00000516149 96 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 AP003031.2-202ENST00000533590 572 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 LINC01243-201ENST00000562065 721 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 AC007494.1-201ENST00000562293 760 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 BLOC1S6-209ENST00000565409 616 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 MTATP6P2-201ENST00000603319 678 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 RPL12P48-201ENST00000605620 304 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 AC097460.3-201ENST00000623099 442 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 ZNF253-205ENST00000640599 1208 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 RXFP1-211ENST00000613319 3771 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 ADAL-203ENST00000428046 3514 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 LRRTM4-205ENST00000409911 2976 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 POM121L2-202ENST00000444565 3108 ntAPPRIS P2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 SLC17A2-203ENST00000377850 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 AC127164.1-201ENST00000548738 4196 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 OR2AG1-202ENST00000641258 6993 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 WASHC4-214ENST00000620430 5807 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 AC005725.1-201ENST00000577346 2607 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 TESPA1-212ENST00000532804 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 SMCO1-201ENST00000397537 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 ASNS-209ENST00000444334 1812 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 LYPD6B-201ENST00000280115 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 PPCS-201ENST00000372556 984 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 MRRF-207ENST00000373729 870 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 LSM5-203ENST00000409782 649 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 AC069282.1-201ENST00000411911 526 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 PTCD2P2-201ENST00000415579 1095 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 AL354956.1-201ENST00000424487 467 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 AL669841.1-201ENST00000425723 558 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 MRPL50P1-201ENST00000431951 384 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 AL121759.1-201ENST00000434043 795 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 AC003991.1-210ENST00000434733 1048 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 AC064862.4-201ENST00000442180 334 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 AL445307.1-201ENST00000446476 602 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 AC073072.2-201ENST00000447425 348 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 YWHAEP1-201ENST00000453697 763 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 ST20-201ENST00000478497 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 MTCO2P9-201ENST00000503214 694 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 AC079858.1-201ENST00000507842 448 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 AC010468.3-201ENST00000508225 458 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 CYP4F27P-201ENST00000514557 494 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 AP003386.1-201ENST00000526509 504 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 AP003086.3-201ENST00000527030 365 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 AC074029.2-201ENST00000551045 634 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 AL163195.3-202ENST00000555283 578 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 AC009396.2-201ENST00000555954 700 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 AC021351.1-202ENST00000561394 701 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 ANKRD20A5P-203ENST00000580200 566 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 VN1R81P-201ENST00000602085 372 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 AC009237.12-201ENST00000604755 742 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 AC013244.3-201ENST00000605614 388 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 RN7SL787P-201ENST00000613000 284 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 AC018659.2-201ENST00000624690 715 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 PCBP1-AS1-282ENST00000625783 826 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 OR4G1P-202ENST00000641173 1788 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 RBM48-202ENST00000481551 4093 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 ASCC1-203ENST00000342444 2270 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 BEND2-201ENST00000380030 1938 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 SSH2-204ENST00000540801 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 TM9SF4-202ENST00000398022 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 KCTD4-201ENST00000379108 1865 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 RPTN-201ENST00000316073 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 AMOT-206ENST00000524145 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 ASAH1-232ENST00000636691 2472 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 AC005480.1-202ENST00000555916 3548 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.5 ms