Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 LINC01612-201ENST00000504509 469 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 RPS3A-204ENST00000506126 862 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 AC010343.2-201ENST00000510162 224 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 SPINK13-203ENST00000512953 1022 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 AC018607.1-201ENST00000518552 673 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 IGHV1-14-201ENST00000523391 241 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 AP002370.2-201ENST00000531424 545 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 IFNG-AS1-201ENST00000536914 494 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 AC139697.1-201ENST00000548429 745 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 AC089998.2-201ENST00000551856 277 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 LINC01580-202ENST00000555364 661 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 AC027176.2-201ENST00000559166 746 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 AC026471.4-201ENST00000569291 449 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 AC008914.1-201ENST00000576302 797 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 ZNF528-211ENST00000598192 625 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 AL132655.1-201ENST00000601795 1153 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 AC009464.1-201ENST00000615731 469 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 AL163051.2-201ENST00000618976 735 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 TCL6_3.1-201ENST00000619064 137 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 AC006386.1-201ENST00000619436 415 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 ST6GALNAC3-203ENST00000621530 617 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 AC013437.2-201ENST00000639587 677 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 AC141930.3-201ENST00000640435 762 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 SDAD1-201ENST00000356260 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 NEGR1-202ENST00000357731 12811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 CNTN1-204ENST00000547849 3125 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 NBEA-207ENST00000537702 4089 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 FASTKD2-201ENST00000236980 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 RGPD1-206ENST00000641458 5271 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 ASAH1-232ENST00000636691 2472 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 SLC2A14-203ENST00000431042 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 PLCE1-201ENST00000371375 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 BICRAL-202ENST00000394168 6515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 INTS12-211ENST00000618810 1502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 HCG18-237ENST00000444126 4605 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 AL136985.3-202ENST00000636386 2708 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 CXCL8-201ENST00000307407 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 ZNF184-202ENST00000377419 2899 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 AC008627.1-201ENST00000517511 1704 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 AHNAK2-201ENST00000333244 18254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 ARHGAP15-201ENST00000295095 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 PIH1D3-203ENST00000535523 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 CASC11-201ENST00000502463 3301 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 CASP1-215ENST00000533400 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 ACOD1-202ENST00000449753 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 PSD3-202ENST00000327040 11689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 LPAR6-201ENST00000345941 2428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 HHLA1-201ENST00000414222 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 CUL1-204ENST00000617797 2508 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 BRIP1-201ENST00000259008 6048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 C14orf105-201ENST00000216445 3082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 TRAPPC13-202ENST00000399438 3221 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 RAB3B-201ENST00000371655 12844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 FDCSP-201ENST00000317987 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 HNMT-203ENST00000329366 835 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 RN7SKP162-201ENST00000363605 345 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 MIR585-201ENST00000384887 94 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 SPTLC1P2-201ENST00000407089 121 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 AC017048.1-201ENST00000412153 495 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 OR2X1P-201ENST00000421144 687 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 MTND4LP14-201ENST00000429447 288 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 PTMAP6-201ENST00000439110 327 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 AC139712.3-201ENST00000443926 639 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 MORF4-201ENST00000447135 971 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 AC011196.1-201ENST00000451816 595 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 AC109361.2-202ENST00000512514 483 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 TMEM68-213ENST00000522576 826 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 MORF4L1P3-201ENST00000525966 950 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 BMPR1APS2-201ENST00000527904 1012 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 AC027026.1-201ENST00000532323 742 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 MYRFL-202ENST00000535034 881 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 LDHC-203ENST00000535809 757 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 LINC02454-201ENST00000539116 589 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 AC084200.1-201ENST00000547370 547 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 AC087888.1-201ENST00000550884 1254 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 LINC02319-201ENST00000555852 349 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 AL139021.2-201ENST00000556390 399 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 INO80-AS1-201ENST00000558967 312 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 AC084759.1-201ENST00000561168 290 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 AC009120.3-201ENST00000563335 499 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 BLOC1S6-209ENST00000565409 616 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 AC010547.6-201ENST00000571789 193 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 AC012370.2-201ENST00000597541 1080 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 AL450270.1-201ENST00000606160 391 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 AC108673.3-201ENST00000609183 335 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 Metazoa_SRP.134-201ENST00000610965 327 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 RFPL4AP6-201ENST00000616792 846 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 KLRC2-206ENST00000619500 883 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms