Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 MRE11-209ENST00000540013 1212 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
TRIM5Q9C035 TDGP1-201ENST00000543961 1229 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TRIM5Q9C035 AC093510.2-201ENST00000562820 896 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TRIM5Q9C035 AC091304.5-201ENST00000568969 158 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TRIM5Q9C035 AC027281.1-201ENST00000574178 758 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TRIM5Q9C035 AC103808.4-201ENST00000577258 391 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
TRIM5Q9C035 AC016839.1-201ENST00000578162 867 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TRIM5Q9C035 AC134669.2-201ENST00000578584 1008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
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TRIM5Q9C035 AP005136.2-201ENST00000583253 1049 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TRIM5Q9C035 AC018371.1-201ENST00000584560 640 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
TRIM5Q9C035 AC010503.3-201ENST00000594355 540 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TRIM5Q9C035 CT45A1-202ENST00000594565 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
TRIM5Q9C035 LSM1P2-201ENST00000604911 322 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TRIM5Q9C035 RPSAP75-201ENST00000605848 301 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TRIM5Q9C035 AL355802.4-201ENST00000607635 548 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TRIM5Q9C035 RNU6-84P-201ENST00000607737 102 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TRIM5Q9C035 AC034229.4-201ENST00000607861 441 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TRIM5Q9C035 AL356608.1-201ENST00000610034 820 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TRIM5Q9C035 AL049777.1-201ENST00000622740 518 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TRIM5Q9C035 AC010872.1-201ENST00000624225 675 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TRIM5Q9C035 AL161457.2-201ENST00000629181 630 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
TRIM5Q9C035 CAPN6-201ENST00000324068 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
TRIM5Q9C035 GYPA-212ENST00000616983 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
TRIM5Q9C035 RASSF8-201ENST00000282884 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
TRIM5Q9C035 HACD3-211ENST00000569894 1471 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
TRIM5Q9C035 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.39
TRIM5Q9C035 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
TRIM5Q9C035 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
TRIM5Q9C035 CENPN-203ENST00000393335 1556 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
TRIM5Q9C035 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TRIM5Q9C035 MAGEB16-203ENST00000399988 1682 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TRIM5Q9C035 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
TRIM5Q9C035 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
TRIM5Q9C035 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
TRIM5Q9C035 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
TRIM5Q9C035 AC015971.1-203ENST00000426549 1948 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
TRIM5Q9C035 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TRIM5Q9C035 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
TRIM5Q9C035 MRPL47-201ENST00000259038 1126 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
TRIM5Q9C035 AL353625.1-202ENST00000366273 571 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
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TRIM5Q9C035 MBNL1-219ENST00000492948 1054 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
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TRIM5Q9C035 AC009884.1-201ENST00000522670 545 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
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TRIM5Q9C035 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
TRIM5Q9C035 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
TRIM5Q9C035 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
TRIM5Q9C035 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
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TRIM5Q9C035 CYP3A7-CYP3A51P-202ENST00000620220 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
TRIM5Q9C035 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
TRIM5Q9C035 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TRIM5Q9C035 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
TRIM5Q9C035 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
TRIM5Q9C035 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
TRIM5Q9C035 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
TRIM5Q9C035 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TRIM5Q9C035 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TRIM5Q9C035 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TRIM5Q9C035 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
TRIM5Q9C035 RPL6-201ENST00000202773 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
TRIM5Q9C035 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TRIM5Q9C035 HBG1-201ENST00000330597 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
TRIM5Q9C035 RNU1-134P-201ENST00000362935 165 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TRIM5Q9C035 SNORA72.3-201ENST00000365074 132 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TRIM5Q9C035 AL591503.1-201ENST00000366224 477 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TRIM5Q9C035 CXorf66-201ENST00000370540 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
TRIM5Q9C035 MYO3A-202ENST00000376301 727 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TRIM5Q9C035 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TRIM5Q9C035 GAS5-202ENST00000414075 413 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
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