Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 AC018793.1-201ENST00000638166 585 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TWISTNBQ3B726 AC018793.2-201ENST00000639584 585 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TWISTNBQ3B726 AC018793.3-201ENST00000640805 585 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TWISTNBQ3B726 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TWISTNBQ3B726 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TWISTNBQ3B726 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TWISTNBQ3B726 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
TWISTNBQ3B726 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TWISTNBQ3B726 EPPIN-202ENST00000354280 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
TWISTNBQ3B726 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
TWISTNBQ3B726 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TWISTNBQ3B726 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TWISTNBQ3B726 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TWISTNBQ3B726 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TWISTNBQ3B726 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TWISTNBQ3B726 LGALS8-220ENST00000526634 1852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TWISTNBQ3B726 MIR323B-201ENST00000385269 82 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TWISTNBQ3B726 AL049749.1-201ENST00000430281 632 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TWISTNBQ3B726 CYCSP12-201ENST00000437729 300 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TWISTNBQ3B726 AL122019.1-201ENST00000438575 798 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TWISTNBQ3B726 CEP170-216ENST00000490813 1070 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TWISTNBQ3B726 AC027627.1-201ENST00000506895 753 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TWISTNBQ3B726 AC106732.1-201ENST00000512458 550 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TWISTNBQ3B726 ZCCHC10-210ENST00000513848 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TWISTNBQ3B726 IGKV2-18-201ENST00000522607 343 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TWISTNBQ3B726 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TWISTNBQ3B726 AC113386.1-201ENST00000523584 381 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TWISTNBQ3B726 LINC01947-201ENST00000523742 566 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TWISTNBQ3B726 GPRC5D-AS1-208ENST00000545914 566 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TWISTNBQ3B726 BLZF2P-201ENST00000553776 1130 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TWISTNBQ3B726 C16orf52-205ENST00000567004 951 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TWISTNBQ3B726 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TWISTNBQ3B726 MIR3176-201ENST00000582210 90 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TWISTNBQ3B726 ZNF561-AS1-207ENST00000591932 676 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TWISTNBQ3B726 AC005840.5-201ENST00000619166 599 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TWISTNBQ3B726 AC079298.3-203ENST00000623269 555 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TWISTNBQ3B726 AC063952.1-204ENST00000635496 927 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TWISTNBQ3B726 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TWISTNBQ3B726 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TWISTNBQ3B726 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TWISTNBQ3B726 FAT4-202ENST00000394329 16123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TWISTNBQ3B726 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TWISTNBQ3B726 LINS1-214ENST00000561308 1612 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TWISTNBQ3B726 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TWISTNBQ3B726 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TWISTNBQ3B726 PSG9-202ENST00000270077 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
TWISTNBQ3B726 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TWISTNBQ3B726 NBPF14-211ENST00000621070 2701 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TWISTNBQ3B726 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
TWISTNBQ3B726 DCN-204ENST00000425043 1438 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
TWISTNBQ3B726 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TWISTNBQ3B726 RN7SKP162-201ENST00000363605 345 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TWISTNBQ3B726 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TWISTNBQ3B726 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TWISTNBQ3B726 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TWISTNBQ3B726 AL031767.1-201ENST00000426374 386 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TWISTNBQ3B726 AL807757.1-201ENST00000437846 424 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TWISTNBQ3B726 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TWISTNBQ3B726 AL133445.1-201ENST00000467051 452 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TWISTNBQ3B726 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TWISTNBQ3B726 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TWISTNBQ3B726 MTND6P2-201ENST00000512226 524 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TWISTNBQ3B726 AC011124.1-204ENST00000522265 562 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TWISTNBQ3B726 MS4A3-208ENST00000534744 507 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
TWISTNBQ3B726 AC073569.1-201ENST00000548469 667 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TWISTNBQ3B726 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TWISTNBQ3B726 AC008555.3-201ENST00000603717 442 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TWISTNBQ3B726 AK3-201ENST00000359883 1536 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
TWISTNBQ3B726 CYP4Z2P-201ENST00000423332 1512 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TWISTNBQ3B726 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TWISTNBQ3B726 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TWISTNBQ3B726 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
TWISTNBQ3B726 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
TWISTNBQ3B726 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
TWISTNBQ3B726 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
TWISTNBQ3B726 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TWISTNBQ3B726 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TWISTNBQ3B726 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TWISTNBQ3B726 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TWISTNBQ3B726 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TWISTNBQ3B726 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
TWISTNBQ3B726 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TWISTNBQ3B726 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
TWISTNBQ3B726 MDN1-205ENST00000629399 17400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
TWISTNBQ3B726 SPATA4-201ENST00000280191 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
TWISTNBQ3B726 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TWISTNBQ3B726 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TWISTNBQ3B726 FAIM-204ENST00000393035 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
TWISTNBQ3B726 RN7SKP229-201ENST00000410465 302 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TWISTNBQ3B726 RN7SKP59-201ENST00000410520 314 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TWISTNBQ3B726 NPM1P4-201ENST00000414095 812 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TWISTNBQ3B726 CFL1P1-202ENST00000432948 411 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TWISTNBQ3B726 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TWISTNBQ3B726 SPRYD7P1-201ENST00000443861 570 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TWISTNBQ3B726 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TWISTNBQ3B726 AC011225.1-201ENST00000457751 369 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TWISTNBQ3B726 RPS26P39-201ENST00000469206 341 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TWISTNBQ3B726 UBA52P7-201ENST00000486088 380 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TWISTNBQ3B726 AC011411.1-201ENST00000509592 876 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TWISTNBQ3B726 AC103855.1-201ENST00000525926 564 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.1 ms