Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 CDY2A-201ENST00000250838 1954 ntAPPRIS ALT1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 ADGRL3-213ENST00000509896 5069 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 LINC00507-201ENST00000540882 1935 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 ZNF844-201ENST00000439326 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 MIR640-201ENST00000385086 96 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 AK3P5-201ENST00000432033 519 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 CYP4F27P-201ENST00000514557 494 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 AC114876.1-201ENST00000490962 1366 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 LINS1-214ENST00000561308 1612 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 SPTAN1-222ENST00000630804 7812 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 ZNF229-204ENST00000614049 4507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 ANKRD26-202ENST00000436985 6827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 ZNF605-204ENST00000392321 6156 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 IL5-201ENST00000231454 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 RN7SKP151-201ENST00000410230 316 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 AL354896.1-201ENST00000430214 561 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 AL451063.1-201ENST00000450164 1133 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 MIR100HG-221ENST00000534297 572 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 AC007346.2-201ENST00000564816 892 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 HEPH-206ENST00000441993 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 MYT1L-202ENST00000399161 7063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 AC099506.1-201ENST00000567359 4037 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 CNOT1-202ENST00000441024 4999 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 HDAC9-202ENST00000405010 4239 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 DPYD-202ENST00000370192 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 CYP2AC1P-201ENST00000407830 1173 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 AC021074.2-201ENST00000468434 172 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 FOXP2-203ENST00000378237 2187 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 MTHFD1-202ENST00000545908 6814 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 BEND2-201ENST00000380030 1938 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 RNF4-214ENST00000511600 4123 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 ZEB2-236ENST00000636471 9583 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 NOL8-208ENST00000442668 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 MTCO1P15-201ENST00000529569 1526 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 OR11H6-201ENST00000315519 993 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 AC104119.1-201ENST00000508829 339 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 AC004890.3-201ENST00000605566 1095 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 DARS-AS1-227ENST00000627442 633 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 AC011503.1-201ENST00000596326 1585 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 AP004147.1-201ENST00000505153 6314 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 JAKMIP2-201ENST00000265272 6001 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 CRYAB-201ENST00000227251 848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 SPATA42-201ENST00000369989 535 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 LINC01198-201ENST00000416521 500 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 SLC6A13-202ENST00000436453 1101 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 PTER-205ENST00000535784 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 ARL6IP1P1-201ENST00000545836 610 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 AC004232.3-201ENST00000622977 525 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 PCBP1-AS1-286ENST00000625888 765 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 MYO6-201ENST00000369975 5387 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 MMAA-205ENST00000541599 1437 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 AC234781.1-202ENST00000412436 1329 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 BDNF-203ENST00000395978 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 DNAJC16-202ENST00000375847 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 SLC35F5-213ENST00000638402 1554 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 ZBTB21-205ENST00000398511 5608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 OR6N2-202ENST00000641131 3455 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 TEX41-203ENST00000420472 765 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 AL591178.1-201ENST00000439239 454 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 LINC02050-201ENST00000473938 712 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 AC139713.2-213ENST00000505000 796 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 AC113349.1-201ENST00000512105 583 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 OR5M2P-201ENST00000529003 936 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 AC090592.1-202ENST00000533049 568 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 AL121790.1-201ENST00000554829 738 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 AP005119.2-201ENST00000579735 1105 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
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