Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 GABRA1-211ENST00000635880 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 NRK-201ENST00000243300 8062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 ABL2-201ENST00000344730 6910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 CEBPZ-201ENST00000234170 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 PDGFRA-201ENST00000257290 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 PEX13-201ENST00000295030 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 APOOL-202ENST00000613473 6445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 ALG10-201ENST00000266483 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 AC003973.2-201ENST00000596778 1394 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 CYP2C8-212ENST00000623108 1962 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 CTAGE5-201ENST00000280082 2554 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 ZHX3-205ENST00000432768 3551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 PTK2-228ENST00000521059 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 ZNF438-201ENST00000331737 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 ZC3H7A-214ENST00000575984 2632 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 DCHS2-207ENST00000623607 8912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 ALG2-202ENST00000319033 1627 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 KCNRG-202ENST00000360473 1623 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 CHST12-201ENST00000258711 15979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 ABLIM1-214ENST00000533213 7606 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 PDZD2-202ENST00000438447 11704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 AL160408.3-201ENST00000442382 3564 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 AC068870.3-201ENST00000625077 2536 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 INTS4-209ENST00000534064 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 XAGE3-201ENST00000346279 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 S100A1-202ENST00000368696 522 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 ZNF292-202ENST00000369577 10610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 IL6-203ENST00000401651 539 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 ERHP2-201ENST00000402323 299 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 SNORA11.5-201ENST00000408163 128 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 RNU4ATAC2P-201ENST00000408674 126 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 EMX2OS-201ENST00000412075 1025 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 AL445213.1-201ENST00000412589 747 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 LINC00867-202ENST00000415417 488 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 AC087857.1-201ENST00000425894 467 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 FBXW12-203ENST00000436231 1117 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 AL138767.3-201ENST00000438082 495 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 SMIM30-204ENST00000441359 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 AL136460.1-201ENST00000442389 473 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 AL606490.1-201ENST00000452266 765 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 OR52E7P-201ENST00000452394 933 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 Z99127.1-201ENST00000452442 670 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 BBIP1-208ENST00000454061 812 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 AL133244.1-201ENST00000456007 258 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 AC044810.1-201ENST00000480271 711 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 RN7SL382P-201ENST00000482631 282 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 CPHL1P-204ENST00000482639 584 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 AC091868.2-201ENST00000506717 556 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 AC118282.2-201ENST00000508739 374 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 OR52H2P-201ENST00000514607 902 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 LINC02482-202ENST00000515205 422 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 AC010306.1-201ENST00000523223 1117 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 AP003100.1-201ENST00000524772 832 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 AC125612.1-201ENST00000547580 377 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 LINC02402-201ENST00000550337 1212 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 AC023905.1-201ENST00000559799 1178 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 CAPN3-210ENST00000561817 915 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 STRADA-207ENST00000578008 1153 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 TTC39C-AS1-201ENST00000579713 817 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 DIAPH2-AS1-204ENST00000579945 974 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 LINC01916-201ENST00000582028 559 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 TEX41-222ENST00000597173 1134 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 AC068790.7-201ENST00000602347 528 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 AC125494.2-201ENST00000602431 657 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 AC091057.2-201ENST00000602594 792 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 AC100767.2-201ENST00000604840 693 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 AL021368.3-201ENST00000607119 578 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 HOXA11-AS1_3.1-201ENST00000613383 98 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 Metazoa_SRP.129-201ENST00000619776 251 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 KBTBD2-208ENST00000621876 1196 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 AC034229.6-201ENST00000623704 224 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 LGI1-209ENST00000627699 664 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 AC245088.3-201ENST00000634383 424 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 AL049767.1-201ENST00000636811 514 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 AL354702.2-202ENST00000641481 890 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 MEIS1-209ENST00000488550 5111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 LYSMD3-201ENST00000315948 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 C2CD5-212ENST00000542676 3438 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 AP2B1-211ENST00000610402 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 LMO3-235ENST00000616247 3227 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 GPRIN3-202ENST00000609438 14244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 TCP11X2-202ENST00000453326 1747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 TCP11X1-201ENST00000597070 1747 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 SLFN12-201ENST00000304905 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
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