Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 AC018695.3-201ENST00000602617 408 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 FGFR1OP-202ENST00000366847 14166 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 ELAVL4-202ENST00000371819 2467 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 AC134980.1-209ENST00000639059 2317 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 KLHL13-202ENST00000371876 5331 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 PKIA-201ENST00000352966 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 CASC19-281ENST00000642118 1554 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 NOSTRIN-202ENST00000397206 1446 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 ZRANB3-202ENST00000401392 6820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 CNOT1-216ENST00000569240 7660 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 CRYAB-201ENST00000227251 848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 RPL23AP18-201ENST00000416139 468 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 AC107057.1-201ENST00000425763 319 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 AF127577.2-201ENST00000436429 824 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 AC092324.1-201ENST00000468671 324 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 UBE2Q2P10-201ENST00000514854 900 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 PMS2P3-207ENST00000529061 717 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 AL121790.1-201ENST00000554829 738 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 AC005324.5-201ENST00000584540 571 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 MAPK10-350ENST00000641777 965 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 ASCC1-203ENST00000342444 2270 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 PPP1R1C-201ENST00000280295 1636 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 ALG2-202ENST00000319033 1627 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 AC063923.1-201ENST00000478982 1619 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 RCAN2-201ENST00000306764 3240 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 TRIM38-201ENST00000357085 9413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 TMEM133-201ENST00000303130 1953 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 C5orf64-203ENST00000505642 2970 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 LINC00342-201ENST00000412393 654 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 AL008723.2-201ENST00000426354 562 ntTSL 4 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 AC104837.2-201ENST00000427236 424 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 BACH1-IT1-201ENST00000504298 821 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 AC016573.1-201ENST00000523205 539 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 AC092683.1-203ENST00000594050 654 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 AC005725.1-201ENST00000577346 2607 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 LNX2-201ENST00000316334 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 GBA3-205ENST00000511446 2018 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 AP004289.1-201ENST00000436307 2205 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 NOX4-211ENST00000528341 1899 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 ANKRD31-203ENST00000506364 6207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 FSCB-201ENST00000340446 2938 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 HOMEZ-203ENST00000561013 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 AF131216.1-201ENST00000498997 5856 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
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PTCH1Q13635 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
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PTCH1Q13635 NANOGP9-201ENST00000439890 892 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
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PTCH1Q13635 LINC01456-201ENST00000453902 708 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 AC020551.1-201ENST00000512036 539 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 AC144548.2-201ENST00000550231 946 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 FAM174B-202ENST00000553393 495 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 DHFRP1-201ENST00000579682 559 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 AC244517.5-203ENST00000624778 517 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 MT-RNR2-201ENST00000387347 1559 ntBASIC7.65□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 AC021092.1-201ENST00000592946 3199 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 OR1E1-201ENST00000322608 1307 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 MIR4435-2HG-207ENST00000439362 1522 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 HNRNPR-210ENST00000478691 7646 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 APOOL-202ENST00000613473 6445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 TTC39B-207ENST00000507993 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 VPS53-204ENST00000437048 13106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 MGAM-202ENST00000475668 9172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
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