Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 INHBA-AS1-203ENST00000422822 2312 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 NOL4-203ENST00000538587 1979 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 GPN1-205ENST00000458167 1618 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 RN7SKP124-201ENST00000364730 341 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 AL121977.1-201ENST00000401636 979 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 RN7SKP229-201ENST00000410465 302 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 USP24P1-201ENST00000433802 779 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 AP000365.1-201ENST00000438850 546 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 AL442224.1-201ENST00000443771 391 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 LINC01911-201ENST00000450667 806 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 AP000547.1-201ENST00000454360 617 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 AP006216.2-201ENST00000457746 333 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 TOPORSLP1-201ENST00000467693 2102 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 RPS7P6-201ENST00000485777 579 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 UCHL1-AS1-201ENST00000507190 592 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 DUTP7-201ENST00000507982 486 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 SEMA6A-AS1-202ENST00000508424 862 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 LINC02147-201ENST00000509367 807 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 LINC00535-202ENST00000517785 264 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 TRAV11-201ENST00000539512 339 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 LINC02366-202ENST00000541949 696 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 AC007225.2-201ENST00000562529 256 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 AC103808.4-201ENST00000577258 391 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 AL157938.2-209ENST00000589128 792 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 AC135983.2-201ENST00000604301 628 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 HIRAP1-201ENST00000605318 787 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 PROX1-AS1-219ENST00000610094 791 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 AC109309.2-201ENST00000612597 332 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 MIR6886-201ENST00000619864 61 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 UGP2-232ENST00000640075 567 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 CTTNBP2NL-201ENST00000271277 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 ZSCAN4-201ENST00000318203 2246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 GRAMD2B-202ENST00000502348 1363 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 OR12D2-207ENST00000642051 1496 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 OR11H1-201ENST00000252835 982 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 NUDT6-202ENST00000339154 1065 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 AL050305.1-201ENST00000399993 1230 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 RPS26P38-201ENST00000414476 348 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 RNGTTP1-201ENST00000420965 728 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 AC012594.1-271ENST00000438635 736 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 LINC01448-201ENST00000455947 1171 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 LINC02271-202ENST00000506379 596 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 ERVH-1-201ENST00000507666 639 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 AC139722.1-201ENST00000512502 782 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 AC139697.1-201ENST00000548429 745 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 VPS29-210ENST00000552130 1057 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 HNRNPCP1-201ENST00000556181 766 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 OR11H2-201ENST00000556246 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 AC234775.3-201ENST00000564612 656 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 AC004160.1-210ENST00000599875 689 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 AP000894.4-201ENST00000610185 483 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 AL035661.1-201ENST00000620459 1144 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 AC002044.3-201ENST00000623314 541 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 ZNF253-205ENST00000640599 1208 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 HYAL4-202ENST00000476325 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 NAT2-201ENST00000286479 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 ST7-204ENST00000393444 2113 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 RNA5SP132-201ENST00000364725 118 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 AL139095.4-201ENST00000379928 500 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 AL391422.1-201ENST00000402155 436 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 FIGN-202ENST00000409634 746 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 AP000221.1-201ENST00000419694 1046 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 LINC00458-201ENST00000423442 1060 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 AC016994.1-201ENST00000425419 552 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 LINC01344-202ENST00000449842 571 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
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