Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 PFN1P6-201ENST00000476786 399 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 KDELR2-206ENST00000490996 655 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 LINC00632-202ENST00000498732 746 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 LINC01332-201ENST00000506612 502 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 AC008601.1-201ENST00000519892 527 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 AC012613.1-201ENST00000522685 387 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 TPPP2-208ENST00000530140 703 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 AP002370.2-201ENST00000531424 545 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 NPIPA8-202ENST00000541810 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 AC137590.1-201ENST00000542422 495 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 A2MP1-201ENST00000543404 1201 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 NPIPA3-203ENST00000552140 1053 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 NPIPA2-203ENST00000553201 1053 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 SETP1-201ENST00000556014 845 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 AC100821.2-201ENST00000565668 440 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 AL163952.1-202ENST00000569625 600 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 AC243967.1-201ENST00000598976 578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 AC073333.2-201ENST00000603589 769 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 AC124916.2-201ENST00000604416 224 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 BNIP3P7-201ENST00000605641 516 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 AL133406.3-201ENST00000606817 541 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 LINC02362-201ENST00000608785 516 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 AL359091.2-201ENST00000609303 556 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 Z99755.2-201ENST00000610215 364 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 LINC02362-202ENST00000610683 724 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 IQCM-205ENST00000636414 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 OR8D4-201ENST00000321355 1331 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 CHN1-201ENST00000295497 2047 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 SLC26A3-201ENST00000340010 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 AL020995.1-201ENST00000427524 1680 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 STAU2-210ENST00000521210 1950 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 OR2M7-201ENST00000317965 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 DAOA-202ENST00000375936 742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
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CUL3Q13618 LINC01638-201ENST00000418271 552 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 RPS7P3-201ENST00000443360 580 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 BCAP29-207ENST00000445771 1157 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 AC093166.3-201ENST00000448785 303 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
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CUL3Q13618 HMGN1P8-201ENST00000463578 288 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 AC078828.1-201ENST00000471993 458 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
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CUL3Q13618 AC112206.2-204ENST00000504068 793 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
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CUL3Q13618 AC017091.1-202ENST00000510941 504 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
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CUL3Q13618 AC124242.1-205ENST00000517798 646 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 AC009879.1-201ENST00000520029 839 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 AC027117.1-201ENST00000520646 667 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 HGNC:24955-208ENST00000521585 1260 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 AC008680.1-201ENST00000523398 283 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 LGALS8-217ENST00000525042 903 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 OTX2-203ENST00000554559 715 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 THSD4-AS1-201ENST00000561571 554 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 AC117490.2-201ENST00000610042 594 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 AL445670.1-201ENST00000618889 801 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 AL359094.1-201ENST00000627944 566 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 LINC00969-332ENST00000630874 738 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 ODAM-201ENST00000396094 1319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 CYLD-207ENST00000564326 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 AC090181.3-201ENST00000624777 1514 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 LINC01375-201ENST00000428485 1860 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 CRYZ-204ENST00000370872 1592 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 FAS-203ENST00000355279 983 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 RNU6-891P-201ENST00000384280 111 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 PTPN20-208ENST00000395727 790 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 RPL35AP3-201ENST00000414680 288 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 RPL12P43-201ENST00000420608 499 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 RPL6P30-201ENST00000443382 862 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
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