Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 RPSAP21-201ENST00000414293 885 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 RPL6-202ENST00000424576 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 AL683807.1-201ENST00000427886 445 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 AC009299.1-201ENST00000429684 717 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 PET100-201ENST00000456958 219 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 NUTF2P4-201ENST00000458353 381 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 RPL10AP3-201ENST00000462503 651 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 GAPDHP50-201ENST00000464421 993 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 PRKAG2-AS1-201ENST00000464464 382 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 LINC01214-201ENST00000471222 335 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 RPSAP52-201ENST00000489520 1144 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 AC139272.1-201ENST00000505516 640 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 AC010608.1-201ENST00000507964 275 ntTSL 4 BASIC9.97□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 NTAN1P2-201ENST00000515730 940 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 IGKV2D-10-201ENST00000520194 281 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 AC091820.2-201ENST00000521697 523 ntTSL 4 BASIC9.97□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 PCED1B-AS1-205ENST00000548222 625 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 AC016954.1-201ENST00000549976 745 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 AC099508.2-201ENST00000563098 510 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 AC022872.1-201ENST00000568391 781 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 AC010542.1-201ENST00000568430 555 ntTSL 4 BASIC9.97□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 AP001122.1-201ENST00000572256 541 ntTSL 4 BASIC9.97□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 AC090774.3-201ENST00000578666 742 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 AC011824.2-203ENST00000579975 633 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 AC004448.4-204ENST00000585389 743 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 PRKAR1A-214ENST00000588188 1209 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 AC011477.1-201ENST00000591884 544 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 C22orf24-203ENST00000623735 1247 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 AL356599.1-202ENST00000626919 218 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 WDR75-207ENST00000631047 270 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 AC235565.1-201ENST00000456962 1325 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 NCOA4P4-201ENST00000513338 1861 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 CCDC14-203ENST00000409697 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 CBFA2T2-210ENST00000543126 3502 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 TUBA1A-202ENST00000301071 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 ARL14EPL-201ENST00000601302 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 CRX-207ENST00000613299 4193 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 AC079331.2-201ENST00000623462 2546 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 NLRP1-204ENST00000354411 4332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 LINC00616-205ENST00000514600 2017 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 NKD1-201ENST00000268459 17105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 PFKM-203ENST00000359794 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 HSD11B1-203ENST00000367028 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 CNIH4-205ENST00000465271 4125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 INTS6-215ENST00000490542 2307 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 MCM8-204ENST00000378896 3769 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 MYO6-203ENST00000369981 8692 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 EIF4BP5-201ENST00000567338 1795 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 ZNF432-201ENST00000221315 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 NXPE1-201ENST00000251921 1888 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 BMS1P2-202ENST00000532854 1858 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 FKBP5-204ENST00000542713 7384 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 PDPR-201ENST00000288050 9255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 LINC00943-203ENST00000535544 2815 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 SCFD1-202ENST00000396629 2021 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 AC109347.1-201ENST00000562919 2036 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 MIGA1-201ENST00000370791 5288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 OR4D6-201ENST00000300127 1054 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 NPR3-202ENST00000326958 6380 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 Y_RNA.209-201ENST00000364156 111 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 FCRL6-204ENST00000392235 947 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 MYB-206ENST00000420123 1051 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 AP001062.2-201ENST00000426029 127 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 AL122003.1-201ENST00000435206 784 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 SDHDP2-201ENST00000436937 465 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 OR7E116P-201ENST00000448529 957 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 CBX5P1-201ENST00000468470 561 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 MNX1-204ENST00000469500 209 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 AC108114.1-201ENST00000477321 437 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 RPL7P6-201ENST00000480903 738 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 RN7SL124P-201ENST00000498656 285 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 RAB19-203ENST00000537763 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 AL133371.3-201ENST00000556197 549 ntTSL 4 BASIC9.96□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 AC011120.1-201ENST00000583916 624 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 AC091810.1-201ENST00000603131 325 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.6 ms