Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 IGKV5-2-201ENST00000390244 408 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 AL354890.1-201ENST00000413730 346 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 RPL34P3-201ENST00000421454 338 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 AL627308.1-201ENST00000435693 821 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 SUMO2P3-201ENST00000438311 288 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 ARAFP2-201ENST00000440565 559 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 AC016395.1-201ENST00000444086 465 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 RANP2-201ENST00000456833 229 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 AC108751.3-201ENST00000461814 1020 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 DUBR-205ENST00000495228 411 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 AC094108.1-201ENST00000502494 527 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 AC008448.1-201ENST00000505109 584 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 ATG10-208ENST00000513634 618 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 CA3-AS1-203ENST00000524052 430 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 OR52B2-201ENST00000530810 1079 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 RPA2P3-201ENST00000533268 770 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 CLEC2B-202ENST00000538152 745 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 C16orf52-205ENST00000567004 951 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 AP001496.3-201ENST00000580230 913 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 SUMO2P15-201ENST00000604285 278 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 AL645933.2-201ENST00000606743 1207 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 AP003072.5-201ENST00000623872 773 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 MAPKBP1-217ENST00000627631 210 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 AC005703.1-201ENST00000431343 1773 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 AC008505.1-203ENST00000637345 1766 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 AC073429.2-201ENST00000569694 1444 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 AC024587.1-201ENST00000505925 2157 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 ECT2L-203ENST00000423192 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 CRYZ-204ENST00000370872 1592 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 SLAIN1-201ENST00000267219 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 MTND5P23-201ENST00000430812 1655 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 BPY2-201ENST00000331070 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 SNORA43.1-201ENST00000364863 140 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 BPY2C-201ENST00000382287 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 BPY2B-201ENST00000382392 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 AC003035.1-201ENST00000391359 544 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 AC005323.2-201ENST00000399342 583 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 AL096711.1-201ENST00000404780 554 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 AL589994.1-201ENST00000404962 340 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 OR2A25-201ENST00000408898 1014 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 AL020994.2-201ENST00000413244 571 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 AL138733.1-201ENST00000415477 853 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 LINC01661-201ENST00000415910 708 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 AC008164.1-201ENST00000423925 564 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 AL022337.1-201ENST00000434510 357 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 SUMO2P1-206ENST00000445436 284 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 ZNF619P1-201ENST00000446539 752 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 BIRC6-AS1-201ENST00000455572 697 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 PLSCR5-203ENST00000492200 1058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 LYRM4-208ENST00000500576 592 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 AF250324.1-203ENST00000508156 517 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 ST13P12-201ENST00000508958 1094 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 SNORA70.20-201ENST00000516848 126 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 MOCS2-208ENST00000527216 707 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 OR6M2P-201ENST00000529831 871 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 AC068643.1-201ENST00000548594 755 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 AL158058.1-201ENST00000549515 647 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 LINC02412-201ENST00000552584 1269 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 AL049779.3-201ENST00000557141 606 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 LINC02129-201ENST00000564381 692 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 ULK4P1-201ENST00000564495 875 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 AC010547.6-201ENST00000571789 193 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 AC011478.1-201ENST00000593140 554 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 QTRT1P1-201ENST00000604344 1078 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 FAM27E4-201ENST00000605259 342 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 AL008635.1-201ENST00000609073 385 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 AC004948.1-201ENST00000609858 672 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 AL035661.1-201ENST00000620459 1144 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 AC004852.2-201ENST00000614289 2218 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 LINC01277-201ENST00000419957 2398 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 MMAA-205ENST00000541599 1437 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 RBM44-206ENST00000611254 1427 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
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