Protein–RNA interactions for Protein: Q96RW7

HMCN1, Hemicentin-1, humanhuman

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Length 5,635 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMCN1Q96RW7 PKIA-AS1-201ENST00000519242 995 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
HMCN1Q96RW7 AC068672.3-201ENST00000524017 824 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
HMCN1Q96RW7 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HMCN1Q96RW7 AL163932.1-201ENST00000555776 542 ntTSL 4 BASIC1.99□□□□□ -2.09
HMCN1Q96RW7 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HMCN1Q96RW7 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HMCN1Q96RW7 Z98949.1-228ENST00000595093 798 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
HMCN1Q96RW7 SSX2B-202ENST00000596480 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
HMCN1Q96RW7 SUGT1P3-202ENST00000604259 383 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HMCN1Q96RW7 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HMCN1Q96RW7 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HMCN1Q96RW7 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HMCN1Q96RW7 AC105402.3-203ENST00000608822 885 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
HMCN1Q96RW7 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HMCN1Q96RW7 AL445647.2-201ENST00000615170 130 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HMCN1Q96RW7 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HMCN1Q96RW7 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HMCN1Q96RW7 PPP3CB-AS1-213ENST00000620302 501 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
HMCN1Q96RW7 AC018816.2-201ENST00000621460 353 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HMCN1Q96RW7 AL136228.1-201ENST00000622221 319 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HMCN1Q96RW7 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HMCN1Q96RW7 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HMCN1Q96RW7 CYP8B1-201ENST00000316161 3974 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
HMCN1Q96RW7 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HMCN1Q96RW7 SGO1-202ENST00000306698 1531 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
HMCN1Q96RW7 SH3D19-202ENST00000409252 4888 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
HMCN1Q96RW7 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
HMCN1Q96RW7 F5-201ENST00000367796 7039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
HMCN1Q96RW7 F5-202ENST00000367797 7024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
HMCN1Q96RW7 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
HMCN1Q96RW7 MAP1A-201ENST00000300231 10258 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
HMCN1Q96RW7 IL16-201ENST00000302987 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
HMCN1Q96RW7 PRRC2A-202ENST00000376033 6893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
HMCN1Q96RW7 STXBP5-203ENST00000367480 3297 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
HMCN1Q96RW7 LHX4-201ENST00000263726 5820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
HMCN1Q96RW7 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
HMCN1Q96RW7 LANCL1-207ENST00000450366 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
HMCN1Q96RW7 OR7D2-203ENST00000642043 3157 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
HMCN1Q96RW7 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
HMCN1Q96RW7 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC1.99□□□□□ -2.09
HMCN1Q96RW7 PDGFC-203ENST00000502773 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
HMCN1Q96RW7 LNPK-201ENST00000272748 7610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
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HMCN1Q96RW7 SLC12A3-203ENST00000563236 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
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HMCN1Q96RW7 GUCY2C-201ENST00000261170 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
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HMCN1Q96RW7 ZNF585A-205ENST00000588354 596 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
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HMCN1Q96RW7 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
HMCN1Q96RW7 AC091932.2-201ENST00000623014 291 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HMCN1Q96RW7 LINC00976-202ENST00000628064 534 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
HMCN1Q96RW7 AC119674.1-212ENST00000641155 993 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HMCN1Q96RW7 KIF11-201ENST00000260731 4860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
HMCN1Q96RW7 FAM205BP-202ENST00000399773 4009 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HMCN1Q96RW7 RBM12B-201ENST00000399300 7269 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
HMCN1Q96RW7 GPR156-201ENST00000315843 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
HMCN1Q96RW7 TRPV3-211ENST00000616411 5742 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
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HMCN1Q96RW7 CYB5B-201ENST00000307892 4286 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
HMCN1Q96RW7 KLHL7-202ENST00000339077 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
HMCN1Q96RW7 EIF5B-201ENST00000289371 5777 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
HMCN1Q96RW7 APPBP2-201ENST00000083182 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
HMCN1Q96RW7 ABCC11-202ENST00000356608 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
HMCN1Q96RW7 VEPH1-201ENST00000362010 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
HMCN1Q96RW7 MFSD8-217ENST00000641178 4374 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HMCN1Q96RW7 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
HMCN1Q96RW7 CYP3A43-203ENST00000342499 1396 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
HMCN1Q96RW7 SP110-204ENST00000392048 1937 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
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