Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2S1

LTBP4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,624 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4Q8N2S1 SMIM2-IT1-201ENST00000415082 478 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 TXNP2-201ENST00000443918 295 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 AC104257.1-202ENST00000524275 884 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 AC069366.1-201ENST00000583159 838 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 AC020915.5-201ENST00000596836 964 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 AC008655.2-201ENST00000597049 304 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 LINC00632-204ENST00000602830 597 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 AC024589.2-201ENST00000605642 1294 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 KCNJ15-220ENST00000612702 3046 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.48□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 ABCA4-201ENST00000370225 7309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 TLK2-214ENST00000582809 3608 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 KIAA1328-202ENST00000586135 1863 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 OPCML-203ENST00000524381 6424 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 TRG-AS1-201ENST00000629357 3645 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 LINC01958-201ENST00000637749 1941 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 AC068535.1-201ENST00000416008 471 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 AL354896.1-201ENST00000430214 561 ntTSL 4 BASIC7.48□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 AL731661.2-201ENST00000448824 806 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 OR52A4P-201ENST00000472867 958 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 AK3P4-201ENST00000504283 583 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 NDUFB4P12-201ENST00000513465 390 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 YWHABP2-201ENST00000540201 713 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 AL022238.2-202ENST00000607915 658 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 SSH2-204ENST00000540801 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 ATXN3-204ENST00000429774 6713 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 RFX4-203ENST00000392842 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 TNR-202ENST00000367674 12949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 BX284613.1-201ENST00000452221 1641 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 NRXN3-203ENST00000428277 4219 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 MCM10-201ENST00000378694 4587 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 AC105342.1-201ENST00000378334 6848 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 AP003972.1-201ENST00000625192 5446 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 LAMB4-201ENST00000205386 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 AP001324.1-201ENST00000428553 399 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 CLYBL-AS2-201ENST00000430125 695 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 AL022319.1-201ENST00000458183 1167 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 AC104119.1-201ENST00000508829 339 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 AC136424.2-201ENST00000522582 563 ntTSL 4 BASIC7.47□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 AL121790.1-201ENST00000554829 738 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 MTRNR2L12-201ENST00000600213 1049 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 CACNB4-254ENST00000637514 1880 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 PTPRT-207ENST00000373201 12660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 ZNF268-213ENST00000542986 3773 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 UGT2B27P-201ENST00000505092 1620 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 NCOR1-204ENST00000395851 7950 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 DIEXF-202ENST00000491415 8446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 AGBL1-201ENST00000441037 3551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 OR4Q3-202ENST00000642117 2165 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 BNIP3L-202ENST00000518611 1352 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 PKD1L1-201ENST00000289672 9092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 ASPM-203ENST00000367409 10887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 AC092724.1-201ENST00000624623 3397 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 ARPP21-203ENST00000396482 2416 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 OFD1P8Y-201ENST00000449148 1433 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 VTI1A-201ENST00000393077 4131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 CENPIP1-201ENST00000425713 902 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 SNAP25-AS1-204ENST00000451151 867 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 TMED11P-203ENST00000502630 533 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 AC087439.2-201ENST00000519498 552 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 CSNK1A1-210ENST00000606719 835 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 PPP1R12B-204ENST00000391959 15431 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 PDCD6IP-201ENST00000307296 6161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 SYTL2-208ENST00000524452 2733 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 SCN8A-203ENST00000545061 11433 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 PTPRT-204ENST00000373190 12559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 MT-RNR2-201ENST00000387347 1559 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.4 ms