Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 RAPH1-205ENST00000419464 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 TNFAIP6-201ENST00000243347 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 LIPI-204ENST00000614229 1439 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 MARCH6-201ENST00000274140 9569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 HSPD1P14-201ENST00000432666 1618 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 AP002370.1-201ENST00000528055 1602 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 OR4D5-201ENST00000307033 1095 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 OR4S2-201ENST00000312422 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 OR4K5-201ENST00000315915 1078 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 FAM32BP-201ENST00000344033 333 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 OR2J2-202ENST00000377167 1272 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 SLC8A1-AS1-202ENST00000417875 344 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 RPL36P18-201ENST00000419316 318 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 CYP4F30P-202ENST00000420048 405 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 AL513188.1-201ENST00000421167 614 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 CCNB1IP1P1-201ENST00000428976 839 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 CD200R1-203ENST00000440122 847 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 MIR4435-2HG-209ENST00000441075 704 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 RRM2P4-201ENST00000441721 562 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 RAET1E-AS1-201ENST00000446954 491 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 AL627224.1-201ENST00000448334 444 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 AL157371.1-201ENST00000451910 394 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 RPL23AP23-201ENST00000452590 471 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 AC023245.1-201ENST00000468501 517 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 THOC7-AS1-201ENST00000468961 673 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 WDR78-207ENST00000488333 613 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 AC094108.1-201ENST00000502494 527 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 RPS3A-204ENST00000506126 862 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 AC104827.1-202ENST00000511917 1049 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 THUMPD3-AS1-210ENST00000519043 1115 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 AC246817.2-206ENST00000520570 582 ntTSL 4 BASIC6.77□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 LINC02454-201ENST00000539116 589 ntTSL 4 BASIC6.77□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 MRE11-209ENST00000540013 1212 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 RAD51AP1-213ENST00000544927 787 ntTSL 4 BASIC6.77□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 TEX49-202ENST00000548380 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 AC006530.1-201ENST00000555980 571 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 AC092078.2-201ENST00000560900 581 ntTSL 4 BASIC6.77□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 LINC01243-201ENST00000562065 721 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 AC090666.1-201ENST00000578241 445 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 HAUS1-203ENST00000585518 506 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 AC022031.2-203ENST00000587346 565 ntTSL 4 BASIC6.77□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 AC011524.2-201ENST00000589198 399 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 MTCO3P22-201ENST00000603219 784 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 AC013244.1-201ENST00000604279 193 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 RNU6-1192P-201ENST00000612197 107 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 RNU6-489P-201ENST00000618289 107 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 AL133370.2-201ENST00000619934 439 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 AC012254.5-201ENST00000623573 478 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 FRG1DP-201ENST00000635586 771 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 PHACTR2P1-202ENST00000636592 773 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 AC015971.1-203ENST00000426549 1948 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 RTL9-203ENST00000540313 5225 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 AP001541.1-201ENST00000623322 1904 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 ZNF605-204ENST00000392321 6156 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 HCG18-239ENST00000454129 4433 ntTSL 4 BASIC6.77□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 OR2T2-202ENST00000641925 3530 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 TMEM161B-211ENST00000512429 1796 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 CUL1-204ENST00000617797 2508 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 TCF7L2-218ENST00000538897 4000 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 ZNF490-201ENST00000311437 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 CARF-212ENST00000434998 1955 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 MDM4-217ENST00000621032 5592 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 POM121L2-202ENST00000444565 3108 ntAPPRIS P2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 JCHAIN-201ENST00000254801 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 TMEM167B-201ENST00000338272 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 CCDC129-211ENST00000615280 4142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 MEF2C-226ENST00000625674 4343 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 RXFP2-201ENST00000298386 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 RN7SKP128-201ENST00000364270 303 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 ANAPC10P1-201ENST00000395991 556 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 LSM5-206ENST00000409987 504 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 KCNJ13-203ENST00000410029 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 SMIM2-IT1-201ENST00000415082 478 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 Z93019.1-201ENST00000416450 973 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 MS4A6A-202ENST00000420732 863 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 GLUD1P9-201ENST00000420997 1173 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 HMGB3P5-201ENST00000428894 612 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 AL157884.3-201ENST00000448273 1184 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 RPL7P55-201ENST00000450522 746 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 AF015262.1-201ENST00000455028 698 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 AC083795.1-201ENST00000491760 320 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 AC008945.1-201ENST00000505144 499 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 AC096773.1-201ENST00000506852 648 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 IGHV1-14-201ENST00000523391 241 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 AP003066.2-201ENST00000529375 555 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 LINC02448-201ENST00000548613 583 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 AC036103.1-201ENST00000563846 823 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 AC009121.2-202ENST00000572706 505 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 AC129507.1-204ENST00000573601 503 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 AC011473.1-201ENST00000601280 443 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 FAM27E4-201ENST00000605259 342 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 AC008280.3-201ENST00000606436 732 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99 ms