Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AL136982.3-201ENST00000454709 688 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
USF2Q15853 RBMY2HP-201ENST00000457961 720 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AC114982.2-201ENST00000461396 358 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
USF2Q15853 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AC124945.1-201ENST00000485133 188 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
USF2Q15853 CT45A5-201ENST00000487941 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
USF2Q15853 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
USF2Q15853 SNRPCP11-201ENST00000492453 205 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
USF2Q15853 SUCLG2-AS1-203ENST00000496640 862 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AK6-203ENST00000502819 743 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
USF2Q15853 LINC02512-201ENST00000509548 429 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AL049544.1-201ENST00000511849 673 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
USF2Q15853 BAALC-AS1-205ENST00000521102 613 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
USF2Q15853 HGNC:24955-208ENST00000521585 1260 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AC092490.1-202ENST00000540299 809 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
USF2Q15853 LINC02412-201ENST00000552584 1269 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AC234775.3-201ENST00000564612 656 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AL390726.5-202ENST00000564800 256 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
USF2Q15853 DSG1-AS1-202ENST00000578477 588 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
USF2Q15853 ARGFXP2-201ENST00000579304 949 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
USF2Q15853 MIR7515HG-235ENST00000590865 918 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AC008750.7-201ENST00000600765 559 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AL132655.1-201ENST00000601795 1153 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AL353811.1-202ENST00000602614 618 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AL122023.1-201ENST00000622847 530 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AC244205.1-201ENST00000624935 705 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
USF2Q15853 OXSM-209ENST00000626005 309 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
USF2Q15853 CHRM3-AS2-209ENST00000628573 766 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
USF2Q15853 SOX9-AS1-218ENST00000628742 733 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
USF2Q15853 COPS7B-225ENST00000631349 189 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
USF2Q15853 TTC33-206ENST00000636863 1149 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
USF2Q15853 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
USF2Q15853 C11orf54-206ENST00000528099 1862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
USF2Q15853 UEVLD-202ENST00000320750 1799 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
USF2Q15853 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
USF2Q15853 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
USF2Q15853 PDE1A-204ENST00000410103 2000 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
USF2Q15853 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
USF2Q15853 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
USF2Q15853 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
USF2Q15853 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
USF2Q15853 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
USF2Q15853 TCF12-214ENST00000559710 1314 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
USF2Q15853 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
USF2Q15853 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
USF2Q15853 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
USF2Q15853 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
USF2Q15853 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
USF2Q15853 LINC01787-201ENST00000435311 1994 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
USF2Q15853 LIPF-201ENST00000238983 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
USF2Q15853 HSPD1P9-201ENST00000420325 1636 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
USF2Q15853 C3orf35-203ENST00000425564 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
USF2Q15853 SCAMP1-206ENST00000618166 1358 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
USF2Q15853 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
USF2Q15853 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
USF2Q15853 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
USF2Q15853 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AC018717.1-201ENST00000457712 1505 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
USF2Q15853 VPS35P1-201ENST00000563400 1518 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
USF2Q15853 CLEC12A-202ENST00000350667 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
USF2Q15853 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AL353625.1-202ENST00000366273 571 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
USF2Q15853 ST3GAL3-212ENST00000372362 468 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
USF2Q15853 IGHV6-1-201ENST00000390593 415 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
USF2Q15853 SNORA77.2-201ENST00000408571 112 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
USF2Q15853 RN7SKP144-201ENST00000411108 279 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AL157938.2-207ENST00000415391 884 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AL158832.1-201ENST00000429661 406 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
USF2Q15853 TEX41-206ENST00000432608 661 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AL354893.1-201ENST00000433735 348 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
USF2Q15853 BBIP1-205ENST00000436562 383 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AL138787.1-202ENST00000437804 898 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
USF2Q15853 OR3D1P-201ENST00000438288 955 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
USF2Q15853 RPS10P18-201ENST00000442662 495 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AC245291.3-201ENST00000443400 292 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AL512593.1-201ENST00000444758 779 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AC234771.2-201ENST00000445718 597 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AC023271.1-201ENST00000445936 1090 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AC073409.1-201ENST00000451749 269 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AC073486.1-202ENST00000458437 489 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
USF2Q15853 RPL34P33-201ENST00000486062 334 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AC117500.1-201ENST00000497352 755 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
USF2Q15853 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AC112206.2-204ENST00000504068 793 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AC008448.1-201ENST00000505109 584 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
USF2Q15853 OCIAD1-216ENST00000509122 1204 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
USF2Q15853 LINC02503-201ENST00000510505 812 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AC090958.1-201ENST00000511122 351 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
USF2Q15853 GAPDHP71-201ENST00000511530 1003 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
USF2Q15853 NR1I3-229ENST00000511748 480 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
USF2Q15853 LINC02196-201ENST00000512838 568 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
USF2Q15853 IGHV7-34-1-201ENST00000519200 350 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
USF2Q15853 LINC00535-203ENST00000520096 790 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AC090791.1-201ENST00000530960 492 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AC079866.2-201ENST00000541870 515 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.2 ms