Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 C3orf14-207ENST00000542214 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
SS18Q15532 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SS18Q15532 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SS18Q15532 RORA-AS2-202ENST00000561413 576 ntTSL 4 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SS18Q15532 C15orf41-204ENST00000562877 764 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
SS18Q15532 RPS15A-203ENST00000563390 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
SS18Q15532 AC091132.1-201ENST00000588189 547 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SS18Q15532 AC010503.3-201ENST00000594355 540 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SS18Q15532 WBP1LP12-201ENST00000604449 331 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SS18Q15532 FAM27E4-201ENST00000605259 342 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SS18Q15532 NQO2-209ENST00000606474 470 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SS18Q15532 RNU6-84P-201ENST00000607737 102 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SS18Q15532 Six3os1_2.1-201ENST00000616963 217 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SS18Q15532 AC022400.9-201ENST00000623633 273 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SS18Q15532 PCBP1-AS1-282ENST00000625783 826 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SS18Q15532 AP001052.1-201ENST00000626421 99 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SS18Q15532 AJ009632.2-203ENST00000634708 1205 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SS18Q15532 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
SS18Q15532 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
SS18Q15532 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SS18Q15532 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
SS18Q15532 LINC00320-204ENST00000437238 2004 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
SS18Q15532 INSIG2-208ENST00000614681 1347 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SS18Q15532 MRRF-208ENST00000394315 1501 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
SS18Q15532 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SS18Q15532 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SS18Q15532 AC008627.1-201ENST00000517511 1704 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SS18Q15532 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
SS18Q15532 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
SS18Q15532 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SS18Q15532 SMARCA2-206ENST00000382185 1584 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SS18Q15532 AC245100.4-204ENST00000635587 1555 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SS18Q15532 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
SS18Q15532 FAM72A-201ENST00000341209 1774 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
SS18Q15532 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SS18Q15532 FIRRE-202ENST00000637577 1635 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SS18Q15532 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
SS18Q15532 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SS18Q15532 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
SS18Q15532 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SS18Q15532 LINC01699-201ENST00000319701 259 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SS18Q15532 TRIM69-202ENST00000338264 1222 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
SS18Q15532 TSLP-201ENST00000344895 736 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
SS18Q15532 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SS18Q15532 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SS18Q15532 RPL35AP3-201ENST00000414680 288 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SS18Q15532 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SS18Q15532 BX470102.1-201ENST00000420695 531 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SS18Q15532 AL669841.1-201ENST00000425723 558 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SS18Q15532 HTR3E-AS1-201ENST00000431427 515 ntTSL 4 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SS18Q15532 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SS18Q15532 RBMY2AP-201ENST00000445405 1157 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SS18Q15532 AC097463.1-201ENST00000447288 481 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SS18Q15532 IGBP1P3-201ENST00000447449 1000 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SS18Q15532 RBMY2CP-201ENST00000448575 1157 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SS18Q15532 RBMY2DP-202ENST00000448881 1157 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SS18Q15532 KF459542.1-201ENST00000450908 553 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SS18Q15532 RBMY2BP-202ENST00000451071 1156 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SS18Q15532 CFL1P4-201ENST00000451536 498 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SS18Q15532 ATP5J-207ENST00000457143 589 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SS18Q15532 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SS18Q15532 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SS18Q15532 RPL29P23-201ENST00000486188 442 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SS18Q15532 LINC02006-201ENST00000488210 524 ntTSL 4 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SS18Q15532 KDELR2-206ENST00000490996 655 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
SS18Q15532 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SS18Q15532 AC112484.3-201ENST00000505910 329 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SS18Q15532 TPT1-AS1-207ENST00000520310 563 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SS18Q15532 OR4A17P-201ENST00000526032 904 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SS18Q15532 AP000842.2-202ENST00000526211 569 ntTSL 4 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SS18Q15532 AP004609.2-201ENST00000532177 190 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SS18Q15532 CDKN3-206ENST00000541304 1070 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SS18Q15532 AP000593.3-201ENST00000546065 578 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SS18Q15532 PCED1B-AS1-203ENST00000547626 420 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SS18Q15532 AC009396.2-201ENST00000555954 700 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SS18Q15532 AGGF1P7-201ENST00000562369 913 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SS18Q15532 RPGRIP1L-208ENST00000566096 893 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SS18Q15532 AC145285.4-201ENST00000568183 540 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SS18Q15532 ZNF971P-202ENST00000568619 461 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SS18Q15532 AC004232.2-201ENST00000574245 821 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SS18Q15532 AC027216.1-201ENST00000577726 685 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SS18Q15532 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SS18Q15532 MIR4701-201ENST00000583094 63 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SS18Q15532 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SS18Q15532 APOC2-205ENST00000592257 444 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SS18Q15532 Z99755.2-201ENST00000610215 364 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SS18Q15532 AC004801.6-201ENST00000616571 978 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SS18Q15532 AC048341.3-201ENST00000619323 491 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SS18Q15532 AC024884.1-201ENST00000620583 399 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SS18Q15532 AC005899.6-201ENST00000620729 297 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SS18Q15532 AL138693.1-201ENST00000622219 129 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SS18Q15532 AC022021.1-201ENST00000634334 843 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SS18Q15532 OR11H2-202ENST00000641517 1085 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SS18Q15532 AC010099.4-201ENST00000424515 1453 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SS18Q15532 MTCO1P46-201ENST00000451639 1491 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SS18Q15532 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
SS18Q15532 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
SS18Q15532 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
SS18Q15532 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
SS18Q15532 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.1 ms