Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 FAM47E-202ENST00000502320 6249 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 CADM2-202ENST00000405615 1314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 RIPK1-202ENST00000380409 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 PKIB-211ENST00000615438 1936 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 ARHGAP20-203ENST00000527598 5998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 RRM2B-203ENST00000395912 900 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 AL161621.1-201ENST00000444796 340 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 AL589703.1-201ENST00000456032 256 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 AC092112.1-201ENST00000538329 640 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 LINC02404-201ENST00000546710 1188 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 AC095055.1-201ENST00000603472 1113 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 U1.34-201ENST00000618578 162 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 U1.31-201ENST00000620022 160 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 LINC00704-201ENST00000430998 1478 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 FOXJ3-204ENST00000372572 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 ZNF793-202ENST00000542455 4073 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 AL162456.1-201ENST00000634535 2006 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 AC124017.1-201ENST00000508112 1594 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 C5orf34-201ENST00000306862 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 SELE-201ENST00000333360 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 CLEC4D-201ENST00000299665 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 PRDM2-201ENST00000235372 7957 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 ZNF652-201ENST00000362063 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 C6orf89-204ENST00000480824 6861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 ZDBF2-201ENST00000374423 10286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 IKZF3-202ENST00000346243 1296 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 LINC01593-201ENST00000424355 388 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 AC093655.2-201ENST00000425735 631 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 IKZF3-212ENST00000439016 1246 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 OSTCP1-201ENST00000455507 450 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 BRD9P1-201ENST00000529855 560 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 PCNPP1-201ENST00000552501 511 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 AC011447.4-201ENST00000587562 111 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 RFX4-203ENST00000392842 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 EPPIN-202ENST00000354280 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 PLXNC1-205ENST00000547057 2455 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 SMAD5-211ENST00000545279 7012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 OR5AN1-202ENST00000641850 8468 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
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PTCH1Q13635 TOR1AIP1-202ENST00000435319 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 ARFGEF3-201ENST00000251691 14877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 ZBTB34-202ENST00000373452 6528 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 AL451142.1-201ENST00000375867 775 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
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PTCH1Q13635 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 AC019117.1-204ENST00000451792 442 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
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PTCH1Q13635 AC106895.1-202ENST00000502956 777 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
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PTCH1Q13635 MOCS2-209ENST00000582677 741 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 DMD-222ENST00000474231 5209 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 TRIM6-205ENST00000445329 2951 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 ABL2-201ENST00000344730 6910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 KIF20A-201ENST00000394894 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 NCOR1-201ENST00000268712 10720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 AC005703.1-201ENST00000431343 1773 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 SH3D19-201ENST00000304527 5273 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 ATM-201ENST00000278616 13147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 CX3CR1-201ENST00000358309 3151 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 MKL2-202ENST00000571589 8799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 CHRM5-201ENST00000383263 5410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 AL356317.1-201ENST00000396110 1436 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 AL138831.1-201ENST00000415144 209 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 AC079080.1-201ENST00000479841 822 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 RPS7P6-201ENST00000485777 579 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 MTND6P2-201ENST00000512226 524 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 AC025423.4-201ENST00000553141 785 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
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