Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 AC010451.1-201ENST00000509057 556 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 AC078864.1-201ENST00000547538 512 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 AC009167.1-201ENST00000568317 579 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 AC136443.4-201ENST00000568759 579 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 AC243756.1-201ENST00000584068 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 AC009237.13-201ENST00000603193 276 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 AC092266.1-201ENST00000610958 165 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 AL136228.1-201ENST00000622221 319 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 MIR325HG-202ENST00000626832 598 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 FRG1EP-201ENST00000634469 770 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 CASC19-274ENST00000642018 970 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 GPR89A-213ENST00000534502 1644 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 HMMR-202ENST00000358715 2988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 CA1-225ENST00000626824 2405 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 UGP2-203ENST00000445915 1955 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 AC093225.1-201ENST00000506867 1408 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 ODF3-202ENST00000342593 386 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 RNU1-65P-201ENST00000363919 148 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 TMBIM4-203ENST00000398033 844 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 AL354890.1-201ENST00000413730 346 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 NIFKP3-201ENST00000417799 865 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 LINC00434-201ENST00000423739 419 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 AP000295.1-201ENST00000433395 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 CLNS1AP1-201ENST00000435954 682 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 AC013410.1-201ENST00000436223 1232 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 AL158850.1-201ENST00000441249 914 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 TCEA1P3-201ENST00000443005 880 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 RPL6P30-201ENST00000443382 862 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 RBMY2AP-201ENST00000445405 1157 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 IGBP1P3-201ENST00000447449 1000 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 AC005518.1-201ENST00000448131 1116 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 RBMY2CP-201ENST00000448575 1157 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 RBMY2DP-202ENST00000448881 1157 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 UBFD1P1-201ENST00000473259 814 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 AL049874.2-201ENST00000492636 288 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 AC021106.1-201ENST00000509020 1058 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 Vault.2-201ENST00000516519 98 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 AP003031.2-204ENST00000527219 567 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 OR52B2-201ENST00000530810 1079 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 OR5AM1P-201ENST00000532136 1032 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 AC026401.1-201ENST00000549756 530 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 AL845552.1-201ENST00000556820 323 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 ETFRF1-211ENST00000557540 1259 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 INO80-AS1-201ENST00000558967 312 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 AC073941.1-201ENST00000559148 539 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 AC106730.2-201ENST00000566641 540 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 AC074050.3-201ENST00000569175 441 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 AL359091.2-201ENST00000609303 556 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 PROX1-AS1-219ENST00000610094 791 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 SERPINB10-204ENST00000619595 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 AC104966.1-201ENST00000467010 1464 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 SMARCA2-206ENST00000382185 1584 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 PRIM2-201ENST00000274891 864 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 BX470102.1-201ENST00000420695 531 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 HTR3E-AS1-201ENST00000431427 515 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 AL359636.1-201ENST00000433572 522 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 ATP5LP2-201ENST00000440646 311 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 AC093166.3-201ENST00000448785 303 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
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