Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 AC015864.1-201ENST00000496512 544 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 AC020551.1-201ENST00000512036 539 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 SCARNA6.1-201ENST00000516989 238 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 TMEM202-202ENST00000567679 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 AC103810.5-201ENST00000581622 560 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 PAX6-270ENST00000640368 6975 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 ESRRG-201ENST00000359162 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 UTY-215ENST00000618474 6277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 TAF1-204ENST00000423759 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 AL672277.1-201ENST00000420865 588 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 RNGTTP1-201ENST00000420965 728 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 LINC02257-202ENST00000433576 720 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 AL049745.1-201ENST00000433953 286 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 AL122019.1-201ENST00000438575 798 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 AC011753.3-201ENST00000443436 406 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 VDAC2P4-201ENST00000452925 711 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 AC100832.1-201ENST00000471945 383 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 ARHGEF3-AS1-201ENST00000477246 489 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 AC109481.1-201ENST00000509173 282 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 MAL2-207ENST00000522828 603 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 AC055855.3-201ENST00000564269 578 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 AC009237.13-201ENST00000603193 276 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 AC093388.1-201ENST00000609166 430 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 AL445528.2-201ENST00000620582 470 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 CDON-201ENST00000263577 4186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 OR2A42-202ENST00000641810 4946 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 KIAA1671-206ENST00000637069 6510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 AC089998.1-201ENST00000548575 3141 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 SELE-204ENST00000367776 3576 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 FAM13A-201ENST00000264344 5858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 KIAA1217-204ENST00000376454 7381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 U3.28-201ENST00000391249 210 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 TPT1P13-201ENST00000449760 499 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 PGAM1P13-201ENST00000507497 754 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 RPS3A-210ENST00000512690 845 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 LNX1-AS1-204ENST00000514364 495 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 TVP23CP2-201ENST00000571473 623 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 FOPNL-207ENST00000575073 530 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 AC068112.1-201ENST00000580057 346 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 DPY19L3-205ENST00000586987 5925 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 LMO7-202ENST00000341547 7237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 OXCT1-206ENST00000512084 1593 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 AL161911.1-202ENST00000464488 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 TMBIM4-201ENST00000286424 989 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 RRM2B-203ENST00000395912 900 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 AL159174.1-202ENST00000425588 442 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 VN1R21P-201ENST00000426703 765 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 AC076966.1-201ENST00000435560 351 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 PCBP1-AS1-232ENST00000442040 1111 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 AC090193.1-201ENST00000518633 543 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 AC016987.1-201ENST00000558587 499 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 AC004448.4-204ENST00000585389 743 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 HIRAP1-201ENST00000605318 787 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 MTCO1P1-201ENST00000624263 1081 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 AC244517.5-203ENST00000624778 517 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 LINC01359-206ENST00000634775 888 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 CR1-203ENST00000367051 7469 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 CR1-204ENST00000367052 7469 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 CR1-205ENST00000367053 7469 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 TRRAP-202ENST00000359863 12677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 GBA3-205ENST00000511446 2018 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 NIPA1-202ENST00000437912 7613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 DLGAP1-AS2-202ENST00000573177 1388 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 GABRA1-218ENST00000637827 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 SSX3-202ENST00000376893 800 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 RIMKLBP2-201ENST00000424737 654 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 HNRNPA3P4-201ENST00000427514 803 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 LINC02345-203ENST00000558897 405 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
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