Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 DNAJC12-201ENST00000225171 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 OR13F1-201ENST00000334726 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 RNU1-55P-201ENST00000365510 158 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 SULT1C2-204ENST00000409880 1206 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 LINC00400-201ENST00000425609 547 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 CCNB1IP1P2-201ENST00000432876 818 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AC092162.2-201ENST00000438143 532 ntTSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 EMC3-AS1-205ENST00000438698 534 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 GABRG3-AS1-201ENST00000439938 970 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AL445465.1-204ENST00000440220 447 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 CTSLP6-201ENST00000458273 1002 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 PGBD4P1-201ENST00000473644 407 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 RPL7AP23-201ENST00000482625 776 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 RPL37P23-201ENST00000492641 294 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 GTF2F2P1-201ENST00000511083 675 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AC093816.1-201ENST00000515076 913 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 MTCYBP19-201ENST00000517463 1124 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 TBCA-206ENST00000518338 551 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AC022182.1-202ENST00000529234 580 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 NMNAT1P5-201ENST00000559657 841 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AC092140.1-201ENST00000563090 549 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 OR1E3-201ENST00000575608 948 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AC012368.3-201ENST00000604190 219 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AC011891.2-201ENST00000604949 397 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AP003117.2-201ENST00000606010 545 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 MIR7854-201ENST00000620068 65 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 UTY-210ENST00000538878 6574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 DLG2-211ENST00000426717 5927 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 KIAA0100-203ENST00000544884 6856 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AC006058.1-201ENST00000568686 5067 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 SERPINB8-203ENST00000397985 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AC096992.2-201ENST00000609553 1684 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 TAT-201ENST00000355962 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 BEST3-212ENST00000553096 2929 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AL355852.1-201ENST00000454081 1771 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 TIAL1-203ENST00000369093 5072 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 TNRC6A-201ENST00000315183 8303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 MOB4-201ENST00000233892 3785 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 F13A1-201ENST00000264870 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 BTBD7-208ENST00000555525 2328 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 PRIM2-207ENST00000615550 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 LINC02073-201ENST00000588341 2845 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 AC079949.2-201ENST00000617117 2933 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 LINC00261-202ENST00000564492 4912 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 CD46-204ENST00000357714 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 LINC01613-201ENST00000561476 2780 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 ZFX-204ENST00000379188 7513 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 PARD3-212ENST00000544292 2475 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 TMBIM6-209ENST00000547798 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 ZCCHC6-204ENST00000375957 2262 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 CA10-204ENST00000570565 2276 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 CFI-201ENST00000394634 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 ESCO1-204ENST00000622333 1850 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 AC083864.3-202ENST00000570271 1755 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 UGT2B24P-201ENST00000514441 1597 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 AL359694.1-201ENST00000403247 604 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 RN7SKP129-201ENST00000410288 299 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 RN7SKP86-201ENST00000410454 332 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 RN7SKP271-201ENST00000410528 320 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 AC021035.1-201ENST00000421597 427 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 RPS27AP7-201ENST00000422792 455 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 AC244453.3-201ENST00000426275 459 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 CNOT7P1-201ENST00000429006 852 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 RPSAP32-201ENST00000432681 526 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 RAB9AP5-201ENST00000437794 597 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 AL713851.1-201ENST00000438753 918 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 CNOT7P2-201ENST00000441051 832 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 RAB9AP2-201ENST00000443911 597 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 AL137845.2-201ENST00000444292 988 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 AC097359.1-201ENST00000447946 463 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 CCRL1P1-201ENST00000449542 1053 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 L29074.1-201ENST00000456072 534 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 AL603882.1-201ENST00000463059 681 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 RN7SL413P-201ENST00000482700 297 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 AC104971.1-201ENST00000495117 578 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 APOBEC3AP1-201ENST00000511396 287 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 AC246817.1-201ENST00000520024 610 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 OR52K3P-201ENST00000531655 943 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 LINC01491-202ENST00000558792 439 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 AL159169.2-201ENST00000610061 1269 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 Metazoa_SRP.38-201ENST00000615981 254 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 AC126175.1-201ENST00000617041 758 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 MIR6806-201ENST00000622141 64 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 RPSAP68-201ENST00000625020 438 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
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