Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 AC002310.3-201ENST00000569728 723 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AC010401.2-202ENST00000570663 396 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 BCAR4-204ENST00000573319 1273 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AC022655.1-201ENST00000578039 288 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 MIR4502-201ENST00000580432 81 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 TVP23B-209ENST00000581733 1258 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AC135178.6-201ENST00000605314 398 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AL008723.3-201ENST00000608926 449 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AL096803.3-201ENST00000609032 532 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 RN7SL261P-201ENST00000613441 282 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AL357140.4-201ENST00000636827 412 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 OR7A1P-202ENST00000641542 1158 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 C16orf62-204ENST00000448695 3353 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 C16orf62-216ENST00000543152 3352 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AC011503.2-201ENST00000594230 1500 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 FAM114A2-201ENST00000351797 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 OPRM1-206ENST00000419506 1402 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 VEPH1-205ENST00000468233 1401 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 TBC1D23-202ENST00000394144 3677 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 TXNRD1-212ENST00000526390 3808 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 ZNF329-201ENST00000358067 3290 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 FSHB-202ENST00000417547 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 OR4Q3-201ENST00000331723 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 DEFB106A-201ENST00000335186 303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 DEFB106B-201ENST00000335479 316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 TRAV36DV7-201ENST00000390463 356 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AC092642.1-201ENST00000392417 425 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 Z86062.1-201ENST00000406773 777 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 U3.43-201ENST00000410734 213 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AL121882.1-201ENST00000422893 417 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 RPSAP65-201ENST00000429660 595 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 RPL5P7-201ENST00000444235 813 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 VN1R38P-201ENST00000450265 887 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 HMGB1P7-201ENST00000450921 612 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AL450344.2-201ENST00000455229 614 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 RPL7L1P3-201ENST00000455249 689 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 RPSAP39-201ENST00000467439 883 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 RN7SL326P-201ENST00000477493 296 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 RPL12P30-201ENST00000488389 499 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 LINC01995-201ENST00000489016 621 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AC104779.1-201ENST00000503557 441 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 LINC02430-201ENST00000504755 476 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 LINC02270-201ENST00000505386 610 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 MTCO1P31-201ENST00000506355 492 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 HMGN1P15-201ENST00000513870 295 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AC018607.1-201ENST00000518552 673 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AC008632.1-202ENST00000518605 452 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AC021393.1-201ENST00000531077 433 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 MS4A3-208ENST00000534744 507 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 CCND2-AS2-201ENST00000537370 495 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 LRTOMT-218ENST00000541614 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AC078814.2-201ENST00000552996 535 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AC127522.1-201ENST00000560531 751 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AC002519.2-203ENST00000567043 837 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 C16orf97-205ENST00000568524 406 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 LINC01572-205ENST00000570152 360 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AC008914.1-201ENST00000576302 797 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 PIK3C3-207ENST00000587402 452 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 APOC2-203ENST00000590360 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AC243960.1-203ENST00000595395 599 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 LINC01966-201ENST00000595809 821 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 BMS1P7-201ENST00000602440 1052 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AC005776.1-201ENST00000603164 290 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 LAPTM4BP2-201ENST00000604542 446 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AL590426.2-201ENST00000607287 786 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AC004775.1-201ENST00000607389 753 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AL356608.1-201ENST00000610034 820 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AL159169.2-201ENST00000610061 1269 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 GXYLT1P5-202ENST00000618830 589 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 C8orf89-203ENST00000625134 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 COPS7B-225ENST00000631349 189 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AC107398.4-201ENST00000635489 765 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 TTC33-206ENST00000636863 1149 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AC092329.4-204ENST00000639327 549 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 INTS12-211ENST00000618810 1502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 ARHGAP15-201ENST00000295095 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 ZNF578-201ENST00000421239 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 TEX9-209ENST00000561221 2297 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 ADCY10-205ENST00000545172 4966 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 NCOA3-202ENST00000371998 4668 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 RRH-201ENST00000317735 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms