Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2S1

LTBP4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4Q8N2S1 RNASE9-201ENST00000338904 1049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 PGM5-AS1-202ENST00000420855 572 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 AL353801.1-201ENST00000425541 425 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 OSBPL10-AS1-205ENST00000444503 526 ntTSL 4 BASIC7.51□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 CATSPER2P1-205ENST00000446479 419 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 IGKV1OR22-5-201ENST00000458718 354 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 LINC02265-201ENST00000510551 957 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 AC087664.2-202ENST00000521274 515 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 RNASE9-204ENST00000553541 1136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 RNASE9-206ENST00000554964 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 RNASE9-208ENST00000556208 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 RNASE9-210ENST00000557209 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 AC022523.3-201ENST00000559643 410 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 AGGF1P7-201ENST00000562369 913 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 AC079414.3-201ENST00000612986 1090 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 DST-206ENST00000370788 17657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 LRRC37A3-202ENST00000334962 2654 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 SHC4-202ENST00000396535 2799 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 NBPF9-206ENST00000613969 4624 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 LRRC37B-204ENST00000543378 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 CHD2-201ENST00000394196 9363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 AC008957.3-201ENST00000624112 2242 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 MOB1B-201ENST00000309395 6963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 AL591848.4-201ENST00000567832 3472 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 EPPK1-202ENST00000615648 16002 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 CDH6-201ENST00000265071 8476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 AC007557.4-201ENST00000421907 430 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 AC006065.1-201ENST00000422539 802 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 AC104634.1-201ENST00000452720 462 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 AC013356.1-201ENST00000489027 564 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 CYP4F27P-201ENST00000514557 494 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 AZIN1-AS1-203ENST00000517996 756 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 LINC01895-201ENST00000558690 404 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 AL512782.1-201ENST00000603093 364 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 AC004890.3-201ENST00000605566 1095 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 IPO5-229ENST00000631030 192 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 CBFA2T2-203ENST00000346541 7737 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 FGF1-216ENST00000621536 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 MYO5C-201ENST00000261839 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 CLASP1-208ENST00000455322 5660 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 UNC79-206ENST00000621021 7377 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 C20orf194-201ENST00000252032 6869 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 ELP4-229ENST00000640961 8164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 NBPF12-205ENST00000617614 4630 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 LINC00700-201ENST00000413603 2097 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
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LTBP4Q8N2S1 MMACHC-201ENST00000401061 5296 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 ATM-215ENST00000530958 5718 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 BDNF-217ENST00000533131 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 PCAT19-201ENST00000588495 3472 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 MAGEB16-204ENST00000399989 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
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LTBP4Q8N2S1 SNX10-204ENST00000409838 944 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 AC015977.1-201ENST00000418887 292 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
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LTBP4Q8N2S1 MTURN-202ENST00000324489 5605 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 OR52I1-202ENST00000530443 2961 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 CASC19-205ENST00000641013 1411 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 ZNF484-203ENST00000395505 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 NUMB-201ENST00000355058 3342 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 HLF-210ENST00000575345 3589 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 AC007529.1-201ENST00000418574 2178 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 AC010328.1-201ENST00000596769 4060 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 OR7C1-205ENST00000642030 11778 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 GOLGA6L6-201ENST00000619213 4013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 AC135895.1-201ENST00000360528 1058 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
LTBP4Q8N2S1 HSDL2-201ENST00000398803 2983 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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