Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 SLC25A51P1-201ENST00000468432 871 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 AC022075.3-201ENST00000539009 649 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 AL109618.2-201ENST00000605527 211 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 MIR4435-2HG-220ENST00000609902 603 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 LAMB4-201ENST00000205386 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 NUP210L-201ENST00000271854 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 NUMB-201ENST00000355058 3342 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
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CHD4Q14839 GPATCH2L-201ENST00000261530 14007 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 FANCD2-201ENST00000287647 5219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 SORBS1-219ENST00000607232 4374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 RORA-203ENST00000335670 10844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 OLMALINC-203ENST00000641087 3779 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 PPP1R2P3-201ENST00000522232 1991 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 ZBTB21-204ENST00000398505 6846 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 BEND2-201ENST00000380030 1938 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 SH3BGR-203ENST00000380634 816 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 TYRP1-201ENST00000381136 872 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
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CHD4Q14839 AC116036.1-201ENST00000412199 367 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 AL591468.1-201ENST00000417932 573 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 AP000547.1-201ENST00000454360 617 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 NSMCE2-202ENST00000517315 996 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 AC024589.2-201ENST00000605642 1294 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 AC107980.1-201ENST00000558671 3355 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 NRCAM-203ENST00000379024 5782 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 KIAA0586-201ENST00000261244 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
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CHD4Q14839 LRRC8B-203ENST00000439853 7474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 SPA17-204ENST00000532692 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 ZNF184-202ENST00000377419 2899 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 CC2D2A-204ENST00000503292 5175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
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CHD4Q14839 CORIN-201ENST00000273857 4852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
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CHD4Q14839 DCP1A-206ENST00000610213 5994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 IL1RAP-202ENST00000317757 5413 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 BEST1-202ENST00000449131 4267 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 AL022323.4-201ENST00000623980 13120 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 HOMEZ-203ENST00000561013 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 AC005480.1-202ENST00000555916 3548 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 AL008723.2-201ENST00000426354 562 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 TRY2P-201ENST00000448860 689 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 AC073264.2-201ENST00000448886 166 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 VDAC2P4-201ENST00000452925 711 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 RPL23AP72-201ENST00000492447 435 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 DUBR-205ENST00000495228 411 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 CASP1-206ENST00000526568 1061 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 LINC02185-201ENST00000575424 760 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 TTN-AS1-219ENST00000586707 834 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 AL139099.4-201ENST00000614802 114 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 TEX41-254ENST00000626394 423 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 PPP1R1C-201ENST00000280295 1636 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 TMEM132B-201ENST00000299308 10906 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 MIA3-201ENST00000340535 2735 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
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