Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 SUPT3H-206ENST00000637763 498 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 MAPK10-350ENST00000641777 965 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 OAS2-201ENST00000342315 3613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 FAM13C-219ENST00000621119 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 PLRG1-202ENST00000499023 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 ZNF699-203ENST00000591998 3358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 ATMIN-204ENST00000564241 4803 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 MID1-209ENST00000453318 6393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 NBPF26-204ENST00000615145 2656 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 SREK1-203ENST00000380918 2433 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 FRS2-209ENST00000550389 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 LUZP2-201ENST00000336930 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 HORMAD2-202ENST00000403975 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 PCAT19-201ENST00000588495 3472 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 CDY2A-201ENST00000250838 1954 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 PUM2-201ENST00000319801 6002 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 CD200R1L-204ENST00000488794 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 HSPA8P19-201ENST00000505359 1517 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 ZNF532-222ENST00000591083 5324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 NAPEPLD-203ENST00000417955 4988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 RNA5SP132-201ENST00000364725 118 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 AL353625.1-202ENST00000366273 571 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 HMGA1P8-201ENST00000414130 321 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 LINC01820-201ENST00000418415 570 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 NME1P1-201ENST00000420914 382 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 AC008164.1-201ENST00000423925 564 ntTSL 4 BASIC7.38□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 AL022331.1-201ENST00000429025 477 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC7.38□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 DEFA9P-201ENST00000433042 285 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 Z84478.1-201ENST00000438230 1219 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
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TCIRG1Q13488 AL442224.1-201ENST00000443771 391 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 HCG14-201ENST00000444986 413 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 AC005772.1-201ENST00000446671 976 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 AP003774.2-202ENST00000449694 341 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
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TCIRG1Q13488 ZCCHC6-206ENST00000375963 5379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 FAM72B-201ENST00000355228 1773 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 PTPRB-210ENST00000551525 5291 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 HIPK2-202ENST00000406875 15049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
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TCIRG1Q13488 GOLGA6L22-204ENST00000622895 4178 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 SGMS2-203ENST00000394686 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 SSH2-204ENST00000540801 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 AC241584.2-201ENST00000637142 2090 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 CR382285.2-201ENST00000624662 1495 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
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TCIRG1Q13488 DSC1-202ENST00000257198 4225 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 AL669831.5-218ENST00000591702 1873 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 AL117339.4-201ENST00000608335 7063 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 AP003170.5-201ENST00000397185 335 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 AC116036.1-201ENST00000412199 367 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 PSMA3-202ENST00000412908 908 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 AL034345.2-202ENST00000416948 830 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 FCF1P6-201ENST00000456841 595 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 AC004692.2-203ENST00000458590 497 ntTSL 4 BASIC7.37□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 AC022215.1-201ENST00000481770 362 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 AC092916.1-201ENST00000497896 411 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 AC068672.3-203ENST00000505166 311 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 SCARNA6.1-201ENST00000516989 238 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 IGKV2-18-201ENST00000522607 343 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 LINC00687-203ENST00000558175 696 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 LINC00557-201ENST00000563184 1279 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 ULK4P1-201ENST00000564495 875 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 MIR4301-201ENST00000577203 66 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
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