Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 TFPI-204ENST00000409676 1119 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
SP140Q13342 RN7SKP129-201ENST00000410288 299 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SP140Q13342 AC116036.1-201ENST00000412199 367 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SP140Q13342 HMGA1P8-201ENST00000414130 321 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SP140Q13342 AL390774.2-201ENST00000423942 788 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SP140Q13342 DEFB130D-201ENST00000426866 237 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SP140Q13342 FTLP19-201ENST00000433300 394 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SP140Q13342 PA2G4P1-201ENST00000442248 1197 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SP140Q13342 AL136460.1-201ENST00000442389 473 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SP140Q13342 AC139712.3-201ENST00000443926 639 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SP140Q13342 AC022387.1-201ENST00000444770 794 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SP140Q13342 RPS18P1-201ENST00000447840 458 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SP140Q13342 FO393415.3-201ENST00000456424 375 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SP140Q13342 SYT14P1-201ENST00000481459 721 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SP140Q13342 OR9A1P-202ENST00000484361 945 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SP140Q13342 NUDT6-203ENST00000502270 678 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SP140Q13342 BMPR1B-204ENST00000502683 567 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SP140Q13342 LINC02039-201ENST00000507428 566 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SP140Q13342 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SP140Q13342 RFESD-208ENST00000513950 464 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SP140Q13342 LINC01618-201ENST00000514957 727 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
SP140Q13342 RNA5SP400-201ENST00000517155 111 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SP140Q13342 CYCSP25-201ENST00000525280 316 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SP140Q13342 AC069234.2-202ENST00000535720 583 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SP140Q13342 AC005906.2-204ENST00000541095 481 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SP140Q13342 AC027455.1-201ENST00000574104 594 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SP140Q13342 AC008914.1-201ENST00000576302 797 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SP140Q13342 AC104365.1-202ENST00000587080 398 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SP140Q13342 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SP140Q13342 AC112491.1-201ENST00000602890 248 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SP140Q13342 IGLVIVOR22-1-201ENST00000603243 397 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SP140Q13342 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SP140Q13342 AC245100.7-201ENST00000609678 442 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SP140Q13342 MIR6885-201ENST00000612241 66 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SP140Q13342 AC092683.1-209ENST00000612970 1105 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SP140Q13342 AC231759.1-201ENST00000616455 597 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SP140Q13342 ZNHIT3-208ENST00000619730 926 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
SP140Q13342 AL136084.2-203ENST00000630758 690 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SP140Q13342 AC073869.7-201ENST00000640874 297 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SP140Q13342 OR1S2-202ENST00000641683 941 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SP140Q13342 ZNF254-207ENST00000613065 4244 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SP140Q13342 Z83820.1-201ENST00000456978 1499 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SP140Q13342 AP002004.1-201ENST00000532510 3530 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
SP140Q13342 NSD3-206ENST00000527502 4471 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
SP140Q13342 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
SP140Q13342 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SP140Q13342 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
SP140Q13342 AC009095.1-201ENST00000388909 1326 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SP140Q13342 RAPGEF4-204ENST00000409036 3975 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SP140Q13342 FSTL5-201ENST00000306100 4831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
SP140Q13342 ZFY-202ENST00000383052 5113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SP140Q13342 DDX18P6-201ENST00000450119 1997 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SP140Q13342 RIMKLB-207ENST00000538135 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
SP140Q13342 OR2AG1-202ENST00000641258 6993 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SP140Q13342 THAP6-201ENST00000311638 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
SP140Q13342 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
SP140Q13342 MEIOB-201ENST00000325962 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SP140Q13342 PPBP-201ENST00000296028 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
SP140Q13342 OR4K5-201ENST00000315915 1078 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SP140Q13342 CCL20-201ENST00000358813 800 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
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SP140Q13342 CAV1-203ENST00000393468 845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
SP140Q13342 AP002784.2-201ENST00000397300 549 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SP140Q13342 AL391422.1-201ENST00000402155 436 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
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SP140Q13342 SMARCE1P1-201ENST00000417747 1186 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
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SP140Q13342 FSIP2-AS1-202ENST00000436557 689 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
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SP140Q13342 PIK3IP1-AS1-201ENST00000440456 554 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SP140Q13342 UBQLN1P1-207ENST00000441056 1169 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SP140Q13342 VN1R25P-201ENST00000443385 738 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SP140Q13342 NDUFAF4P2-201ENST00000445374 520 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SP140Q13342 Z73417.1-201ENST00000447373 778 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SP140Q13342 AC103563.5-201ENST00000455643 364 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SP140Q13342 VPS25P1-201ENST00000455691 508 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SP140Q13342 RN7SL369P-201ENST00000477138 299 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SP140Q13342 CPHL1P-204ENST00000482639 584 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SP140Q13342 AC116562.1-201ENST00000485355 781 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SP140Q13342 LINC02428-201ENST00000508099 527 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SP140Q13342 GIN1-203ENST00000508629 1040 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
SP140Q13342 MEF2C-AS1-211ENST00000514092 501 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SP140Q13342 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SP140Q13342 HAUS1P3-201ENST00000523909 662 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SP140Q13342 AL137224.1-201ENST00000527984 389 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SP140Q13342 AC135983.3-201ENST00000528049 1226 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SP140Q13342 RPA2P3-201ENST00000533268 770 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SP140Q13342 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SP140Q13342 AL158058.1-201ENST00000549515 647 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
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