Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 C1orf105-201ENST00000367725 888 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 PRPS1-202ENST00000372419 628 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 PPARG-204ENST00000397000 1122 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 RPS3AP26-201ENST00000398259 784 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 SETP15-201ENST00000412724 337 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AC104389.1-201ENST00000418080 522 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 GNRHR-202ENST00000420975 859 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 ZEB2-AS1-203ENST00000428623 436 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 IFNNP1-201ENST00000429219 553 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AC018467.1-202ENST00000432612 533 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 GAPDHP59-201ENST00000435908 267 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AL731544.1-201ENST00000436500 370 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AL122019.1-201ENST00000438575 798 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AC092393.1-201ENST00000439625 742 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 EEF1A1P39-201ENST00000440791 250 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AL731661.2-201ENST00000448824 806 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 BBIP1-208ENST00000454061 812 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 RN7SL834P-201ENST00000461450 286 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AC115223.1-201ENST00000466377 870 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AC104689.1-201ENST00000473356 768 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AC016687.1-201ENST00000482574 353 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AC092691.3-201ENST00000482766 510 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 RN7SL362P-201ENST00000494228 267 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AC095057.1-201ENST00000507583 168 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 RNA5SP441-201ENST00000516809 88 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AC067904.2-201ENST00000517322 1283 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AC011853.1-201ENST00000518911 454 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AL133399.1-201ENST00000527476 298 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AC007876.1-201ENST00000527562 983 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AP003557.1-202ENST00000528978 562 ntTSL 4 BASIC6.91□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 C11orf74-210ENST00000534635 801 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AL135838.1-201ENST00000556080 235 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AC106037.2-201ENST00000578583 447 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AC026898.1-201ENST00000586404 571 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AC104365.1-202ENST00000587080 398 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AC007786.1-202ENST00000590607 443 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AC020915.3-201ENST00000595301 550 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 PCGEM1-202ENST00000606314 759 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AL671511.2-201ENST00000611838 659 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 uc_338.31-201ENST00000615595 186 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AC073592.6-201ENST00000624271 415 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AC010608.2-201ENST00000624830 470 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 LINC01440-210ENST00000629744 541 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 SPATA31C1-201ENST00000420021 3895 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 PMS2-203ENST00000382321 1386 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 PIK3C3-202ENST00000398870 9206 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 ACPP-201ENST00000336375 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 PTPRT-209ENST00000612229 11285 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 DNAH10-210ENST00000638045 13678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 DRP2-204ENST00000538510 6852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 MATR3-215ENST00000510056 3040 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 CLRN1-202ENST00000327047 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 HSD17B13-202ENST00000328546 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 DMTF1-213ENST00000432937 2411 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 MTIF2-201ENST00000263629 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 LRRC31-202ENST00000316428 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AAK1-203ENST00000409085 11345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AC106799.3-201ENST00000562127 3300 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 N4BP2L1-209ENST00000530622 1897 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 TDP1-213ENST00000555880 1894 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 SP110-204ENST00000392048 1937 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 ATP10D-201ENST00000273859 6655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AC114401.1-201ENST00000484222 2084 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 EZH1-202ENST00000428826 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 N4BP2-201ENST00000261435 9744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 PSMA6-201ENST00000261479 1029 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 OR4F6-201ENST00000328882 1238 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 MIR365B-201ENST00000362317 111 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 DEFB132-201ENST00000382376 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 DEFB126-201ENST00000382398 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 RNU6-1005P-201ENST00000384519 107 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 TRAV19-201ENST00000390447 467 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AL136310.1-201ENST00000404926 654 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AC017035.1-201ENST00000411999 1115 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 RPF2P1-201ENST00000424137 906 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AC000041.1-201ENST00000439655 175 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 RPSAP40-201ENST00000442343 891 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AL357052.1-201ENST00000443504 381 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 CUBNP2-201ENST00000443534 1139 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 LINC01035-201ENST00000445072 784 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AC022498.1-201ENST00000449845 696 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 GRIK1-AS1-205ENST00000455392 767 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms