Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 KLHL13-206ENST00000469946 2353 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CLDN9O95484 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CLDN9O95484 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CLDN9O95484 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CLDN9O95484 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CLDN9O95484 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CLDN9O95484 ZNF571-202ENST00000358744 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CLDN9O95484 SAMM50P1-201ENST00000455403 1399 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CLDN9O95484 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CLDN9O95484 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CLDN9O95484 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CLDN9O95484 GRID2-204ENST00000510992 2739 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CLDN9O95484 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CLDN9O95484 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CLDN9O95484 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CLDN9O95484 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CLDN9O95484 RNA5SP433-201ENST00000364491 114 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CLDN9O95484 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CLDN9O95484 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CLDN9O95484 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CLDN9O95484 OR7E101P-201ENST00000400428 513 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CLDN9O95484 NACAP7-201ENST00000407371 609 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CLDN9O95484 TFPI-204ENST00000409676 1119 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CLDN9O95484 RN7SKP240-201ENST00000410583 375 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CLDN9O95484 NENFP1-201ENST00000419476 466 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CLDN9O95484 AC117434.1-201ENST00000419971 836 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CLDN9O95484 AP000470.1-201ENST00000448063 693 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CLDN9O95484 LINC02083-201ENST00000462835 515 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CLDN9O95484 PSAT1P4-201ENST00000466500 526 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CLDN9O95484 DUTP7-201ENST00000507982 486 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CLDN9O95484 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CLDN9O95484 RN7SKP253-201ENST00000516424 309 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CLDN9O95484 IGLV3-24-201ENST00000517477 197 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CLDN9O95484 IGKV2-4-201ENST00000523070 340 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CLDN9O95484 NPM1P5-201ENST00000557228 838 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CLDN9O95484 AC130371.1-201ENST00000577023 230 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CLDN9O95484 AC023389.2-201ENST00000580031 955 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CLDN9O95484 MIR4271-201ENST00000582451 67 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CLDN9O95484 AC090415.2-201ENST00000584078 374 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CLDN9O95484 AL161912.3-201ENST00000605404 628 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CLDN9O95484 AC015849.6-201ENST00000605454 474 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CLDN9O95484 RPL12P48-201ENST00000605620 304 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CLDN9O95484 AC025262.3-201ENST00000623666 360 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CLDN9O95484 MIR325HG-202ENST00000626832 598 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CLDN9O95484 ZNF253-205ENST00000640599 1208 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CLDN9O95484 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CLDN9O95484 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CLDN9O95484 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CLDN9O95484 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CLDN9O95484 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CLDN9O95484 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CLDN9O95484 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CLDN9O95484 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CLDN9O95484 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CLDN9O95484 AC092451.3-201ENST00000625067 1343 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CLDN9O95484 TBC1D15-201ENST00000319106 2159 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CLDN9O95484 AC090518.1-201ENST00000562300 1495 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CLDN9O95484 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CLDN9O95484 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CLDN9O95484 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CLDN9O95484 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CLDN9O95484 PKIB-207ENST00000392491 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CLDN9O95484 NEPNP-201ENST00000404786 1371 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CLDN9O95484 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CLDN9O95484 DBT-201ENST00000370131 1521 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CLDN9O95484 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CLDN9O95484 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CLDN9O95484 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CLDN9O95484 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CLDN9O95484 GAPDHP24-201ENST00000328713 983 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CLDN9O95484 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CLDN9O95484 HCFC2P1-201ENST00000392864 1592 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CLDN9O95484 SNORA11B-201ENST00000408175 129 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CLDN9O95484 LSM5-203ENST00000409782 649 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CLDN9O95484 LINC01980-201ENST00000414382 543 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CLDN9O95484 XIST-201ENST00000416330 750 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CLDN9O95484 AL445190.1-201ENST00000416448 288 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CLDN9O95484 AC009227.2-201ENST00000432599 511 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CLDN9O95484 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CLDN9O95484 AL512637.1-201ENST00000439523 1231 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CLDN9O95484 RPL12P11-201ENST00000439970 501 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CLDN9O95484 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CLDN9O95484 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CLDN9O95484 AL356309.2-201ENST00000454034 719 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CLDN9O95484 AC004692.2-203ENST00000458590 497 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CLDN9O95484 CSNK1A1P3-201ENST00000504105 330 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CLDN9O95484 AC060775.1-201ENST00000518241 520 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CLDN9O95484 OR4A17P-201ENST00000526032 904 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CLDN9O95484 AP002370.2-202ENST00000533669 908 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CLDN9O95484 EOGT-208ENST00000540764 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CLDN9O95484 AC068305.2-201ENST00000550567 1205 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CLDN9O95484 HSPE1P2-201ENST00000554777 306 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CLDN9O95484 AC068722.1-202ENST00000559600 655 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CLDN9O95484 AC092121.1-201ENST00000569452 202 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CLDN9O95484 AC104984.1-201ENST00000581633 697 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CLDN9O95484 AC020909.2-201ENST00000595005 626 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CLDN9O95484 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CLDN9O95484 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CLDN9O95484 LINC01320-205ENST00000604250 857 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CLDN9O95484 AC007786.3-201ENST00000615154 596 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
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