Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 CLEC2B-202ENST00000538152 745 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
ZNRF3Q9ULT6 AC137590.1-201ENST00000542422 495 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
ZNRF3Q9ULT6 CACNA1C-IT1-201ENST00000542984 687 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
ZNRF3Q9ULT6 AL390816.1-201ENST00000553990 322 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
ZNRF3Q9ULT6 LINC02310-201ENST00000556762 572 ntTSL 4 BASIC7.56□□□□□ -1.2
ZNRF3Q9ULT6 CAPN3-210ENST00000561817 915 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
ZNRF3Q9ULT6 AC006504.5-201ENST00000588122 655 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
ZNRF3Q9ULT6 AC010463.2-201ENST00000597592 661 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
ZNRF3Q9ULT6 AC245100.7-201ENST00000609678 442 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
ZNRF3Q9ULT6 MALAT1-205ENST00000610851 584 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
ZNRF3Q9ULT6 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
ZNRF3Q9ULT6 TSHZ2-205ENST00000626626 670 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
ZNRF3Q9ULT6 DLG2-201ENST00000280241 7730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
ZNRF3Q9ULT6 MTND5P11-201ENST00000511037 1812 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
ZNRF3Q9ULT6 DNA2-203ENST00000399180 3207 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
ZNRF3Q9ULT6 AC123769.1-201ENST00000530992 3192 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
ZNRF3Q9ULT6 GRAMD2B-202ENST00000502348 1363 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
ZNRF3Q9ULT6 PRLR-216ENST00000542609 1764 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
ZNRF3Q9ULT6 HDAC9-202ENST00000405010 4239 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
ZNRF3Q9ULT6 AC022325.1-201ENST00000502748 2199 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
ZNRF3Q9ULT6 TRIM49B-202ENST00000622138 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
ZNRF3Q9ULT6 EPB41-201ENST00000343067 5956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
ZNRF3Q9ULT6 PMFBP1-201ENST00000237353 3527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
ZNRF3Q9ULT6 ALS2CR12-203ENST00000405148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
ZNRF3Q9ULT6 AKAP7-201ENST00000263050 2238 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
ZNRF3Q9ULT6 CDH13-201ENST00000268613 2722 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
ZNRF3Q9ULT6 ZNF699-201ENST00000308650 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
ZNRF3Q9ULT6 DSC1-201ENST00000257197 4271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
ZNRF3Q9ULT6 ATP2B4-204ENST00000367218 8918 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
ZNRF3Q9ULT6 AC138915.4-201ENST00000565549 4147 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
ZNRF3Q9ULT6 C11orf74-201ENST00000334307 863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
ZNRF3Q9ULT6 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
ZNRF3Q9ULT6 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
ZNRF3Q9ULT6 MIR513B-201ENST00000385136 84 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
ZNRF3Q9ULT6 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
ZNRF3Q9ULT6 AL023284.3-201ENST00000407767 334 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
ZNRF3Q9ULT6 AL359378.2-201ENST00000415575 746 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
ZNRF3Q9ULT6 AC011752.1-203ENST00000417609 582 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
ZNRF3Q9ULT6 BX323845.3-201ENST00000428215 527 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
ZNRF3Q9ULT6 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
ZNRF3Q9ULT6 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
ZNRF3Q9ULT6 CCRL1P1-201ENST00000449542 1053 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
ZNRF3Q9ULT6 AL139156.3-201ENST00000454802 394 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
ZNRF3Q9ULT6 AL035446.1-201ENST00000455011 453 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
ZNRF3Q9ULT6 NAP1L1P3-201ENST00000462291 880 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
ZNRF3Q9ULT6 AC021074.2-201ENST00000468434 172 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
ZNRF3Q9ULT6 SYT14P1-201ENST00000481459 721 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
ZNRF3Q9ULT6 AC124945.1-201ENST00000485133 188 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
ZNRF3Q9ULT6 LINC00518-204ENST00000491317 1228 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
ZNRF3Q9ULT6 AC011389.1-203ENST00000513790 573 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
ZNRF3Q9ULT6 AC008429.4-201ENST00000521201 182 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
ZNRF3Q9ULT6 TXNRD1-212ENST00000526390 3808 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
ZNRF3Q9ULT6 AP000916.1-201ENST00000533869 835 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
ZNRF3Q9ULT6 LINC02454-201ENST00000539116 589 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
ZNRF3Q9ULT6 AL133166.1-205ENST00000548306 569 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
ZNRF3Q9ULT6 BICD1-206ENST00000551086 423 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
ZNRF3Q9ULT6 GNG2-208ENST00000554875 430 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
ZNRF3Q9ULT6 C15orf41-203ENST00000562489 715 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
ZNRF3Q9ULT6 AC004381.1-201ENST00000565498 351 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
ZNRF3Q9ULT6 AGGF1P6-201ENST00000569213 976 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
ZNRF3Q9ULT6 PRELID3BP3-201ENST00000584963 545 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
ZNRF3Q9ULT6 HAUS1-203ENST00000585518 506 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
ZNRF3Q9ULT6 LINC01198-204ENST00000594153 552 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
ZNRF3Q9ULT6 COX6CP7-201ENST00000597056 208 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
ZNRF3Q9ULT6 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
ZNRF3Q9ULT6 AC091057.2-201ENST00000602594 792 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
ZNRF3Q9ULT6 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
ZNRF3Q9ULT6 AC073137.1-201ENST00000605636 634 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
ZNRF3Q9ULT6 AL008723.3-201ENST00000608926 449 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
ZNRF3Q9ULT6 C8orf89-201ENST00000613105 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
ZNRF3Q9ULT6 AL391095.2-201ENST00000615228 378 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
ZNRF3Q9ULT6 AL512506.2-201ENST00000624472 458 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
ZNRF3Q9ULT6 OR4A15-202ENST00000641526 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
ZNRF3Q9ULT6 AMN1-208ENST00000537562 1538 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
ZNRF3Q9ULT6 LINC01197-205ENST00000614853 1774 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
ZNRF3Q9ULT6 CLEC5A-206ENST00000546910 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
ZNRF3Q9ULT6 ITGA1-201ENST00000282588 10757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
ZNRF3Q9ULT6 MTURN-202ENST00000324489 5605 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
ZNRF3Q9ULT6 FO082842.1-201ENST00000423552 1370 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
ZNRF3Q9ULT6 KLHL13-206ENST00000469946 2353 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
ZNRF3Q9ULT6 NSUN4-208ENST00000498008 3867 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
ZNRF3Q9ULT6 UPRT-207ENST00000530743 1636 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
ZNRF3Q9ULT6 SORBS1-219ENST00000607232 4374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
ZNRF3Q9ULT6 USP29-201ENST00000254181 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
ZNRF3Q9ULT6 SLC16A6-201ENST00000327268 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
ZNRF3Q9ULT6 TTLL5-217ENST00000556893 3071 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
ZNRF3Q9ULT6 CDH12-201ENST00000382254 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
ZNRF3Q9ULT6 NEXMIF-203ENST00000616200 10624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
ZNRF3Q9ULT6 MAML2-202ENST00000618849 3154 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
ZNRF3Q9ULT6 BMPR1B-201ENST00000264568 1807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
ZNRF3Q9ULT6 NUDT13-206ENST00000537969 2151 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
ZNRF3Q9ULT6 TRRAP-202ENST00000359863 12677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
ZNRF3Q9ULT6 TLR10-207ENST00000613579 3801 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
ZNRF3Q9ULT6 CTAGE11P-201ENST00000451540 2353 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
ZNRF3Q9ULT6 UTP15-201ENST00000296792 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
ZNRF3Q9ULT6 SPATA31B1P-201ENST00000434692 4016 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
ZNRF3Q9ULT6 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
ZNRF3Q9ULT6 PBLD-204ENST00000358769 2587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
ZNRF3Q9ULT6 NRCAM-205ENST00000413765 6406 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
ZNRF3Q9ULT6 EIF1B-201ENST00000232905 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.7 ms