Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
MIS18AQ9NYP9 AC005703.1-201ENST00000431343 1773 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
MIS18AQ9NYP9 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 OR7A10-201ENST00000248058 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 RN7SKP6-201ENST00000364795 319 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 AL390774.1-201ENST00000411924 246 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 VN1R21P-201ENST00000426703 765 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 CYCSP6-201ENST00000434498 302 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 LDHAP2-201ENST00000437325 985 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 LINC01344-202ENST00000449842 571 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 LINC01456-201ENST00000453902 708 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 RPS3A-210ENST00000512690 845 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 RN7SKP99-201ENST00000517028 307 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 AC087664.1-201ENST00000521456 358 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 AC078878.1-201ENST00000539832 958 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 ARL2BPP3-202ENST00000580773 420 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 SUMO2P15-201ENST00000604285 278 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 AC016769.4-201ENST00000616893 535 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 AC063952.1-204ENST00000635496 927 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 DCN-218ENST00000551354 2924 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 MUC4-215ENST00000475231 16273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 KIAA0586-214ENST00000619416 8233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 NEMF-201ENST00000298310 6234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 AC109780.1-201ENST00000451768 1344 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 LINC02047-201ENST00000494761 1371 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 DNHD1-212ENST00000527990 14298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 MKL2-202ENST00000571589 8799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 MOB1B-201ENST00000309395 6963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 RANBP3L-202ENST00000502994 2278 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 TRAV9-1-201ENST00000390431 338 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 RPS26P38-201ENST00000414476 348 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 AL592402.1-201ENST00000417161 440 ntTSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 HSPE1P27-201ENST00000430808 296 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 RPL7P45-201ENST00000455851 743 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 488 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 IGHVIII-76-1-201ENST00000523776 286 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 AC078814.2-201ENST00000552996 535 ntTSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 AC023906.4-201ENST00000557898 895 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 AC051619.2-201ENST00000559063 397 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 U1.34-201ENST00000618578 162 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 U1.31-201ENST00000620022 160 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 AC021766.1-201ENST00000624404 741 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 DAOA-212ENST00000640578 378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 CASC19-264ENST00000641912 1184 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 DNAL1-202ENST00000553645 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 NOL4-203ENST00000538587 1979 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 PABPC1P6-201ENST00000445594 1829 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 AC127164.1-201ENST00000548738 4196 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 GKN2-202ENST00000481498 1498 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 VPS13B-202ENST00000357162 14019 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 AC078880.4-201ENST00000617627 1749 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 CCDC169-202ENST00000239860 716 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 OR4K12P-201ENST00000406538 961 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 RPL6P21-201ENST00000418672 846 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 C9orf57-202ENST00000424431 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 AC092168.2-201ENST00000430586 717 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 AL163193.1-201ENST00000444895 788 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 CCDC169-211ENST00000503173 837 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 AC091435.2-201ENST00000514586 565 ntTSL 4 BASIC7.19□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 AC246817.2-206ENST00000520570 582 ntTSL 4 BASIC7.19□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 GTF2H1-208ENST00000526630 932 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 AF107885.2-202ENST00000557653 448 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 AC009019.1-203ENST00000568603 515 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 AC013268.3-201ENST00000262716 2324 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 LINC01020-202ENST00000508201 1800 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 ANO4-202ENST00000392979 3909 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 OR5B2-202ENST00000641342 2184 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 UNC79-203ENST00000553484 9100 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 TCF4-284ENST00000637169 7553 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147.5 ms