Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 AGGF1P7-201ENST00000562369 913 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 ZNF235-204ENST00000589799 955 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 COX6CP7-201ENST00000597056 208 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 AC112211.1-201ENST00000607832 305 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 SNORA11.6-201ENST00000619030 128 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 AC073593.1-201ENST00000624500 411 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 MIR325HG-202ENST00000626832 598 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 SLC9B1P1-201ENST00000331172 1337 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 PMS2-203ENST00000382321 1386 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 RBM41-201ENST00000372479 1662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 IKZF3-213ENST00000439167 1879 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 CLEC4A-204ENST00000360500 597 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 AC066692.1-201ENST00000421721 457 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 AL031767.1-201ENST00000426374 386 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 GNGT1-204ENST00000430875 628 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 TEX41-206ENST00000432608 661 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 AP001604.1-201ENST00000447384 954 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 AC073130.1-202ENST00000454897 587 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 RN7SL170P-201ENST00000487098 295 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 AC027627.1-201ENST00000506895 753 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 IGLV3-24-201ENST00000517477 197 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 AC246817.1-201ENST00000520024 610 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 AC010768.4-201ENST00000528183 520 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 MORF4L1-205ENST00000558502 855 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 DPPA2P4-201ENST00000563717 878 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 AC093524.1-201ENST00000564266 1094 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 DARS-AS1-225ENST00000615163 824 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 AC092683.1-207ENST00000620051 837 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 C3orf35-203ENST00000425564 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 FGL2-201ENST00000248598 4261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 DBT-201ENST00000370131 1521 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 AP000473.2-201ENST00000602659 1537 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 TRAT1-201ENST00000295756 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 DDAH1-204ENST00000535924 3909 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 AC007842.1-201ENST00000597336 2039 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 ZNF630-202ENST00000409324 2455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 GUCA1C-201ENST00000261047 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 TRAV10-201ENST00000390432 379 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 U3.23-201ENST00000391132 200 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 SYCE3-202ENST00000406915 448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 AC009468.1-201ENST00000412800 437 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 AL512637.1-201ENST00000439523 1231 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 BBIP1-208ENST00000454061 812 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 AC111000.6-201ENST00000514471 709 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 RN7SKP253-201ENST00000516424 309 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 AC060775.1-201ENST00000518241 520 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 BCAS2P1-201ENST00000528022 632 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 RERGL-203ENST00000538724 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 MEG8-217ENST00000556637 924 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 AC068722.1-202ENST00000559600 655 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 AC234775.3-201ENST00000564612 656 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 AC090518.1-202ENST00000568246 578 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 AC010401.3-201ENST00000576600 582 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 AC063977.5-201ENST00000601044 974 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 CCL4-202ENST00000615863 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 Six3os1_2.1-201ENST00000616963 217 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 FO681491.1-202ENST00000623392 737 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 AC243960.7-201ENST00000623532 707 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 OR4G1P-202ENST00000641173 1788 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 ZNF571-202ENST00000358744 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.1 ms