Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 AP005264.7-201ENST00000625003 745 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 TMC5-206ENST00000561503 2487 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 AC008147.2-201ENST00000552061 4713 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 RASGRP3-203ENST00000407811 4210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 CD109-201ENST00000287097 9130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 KCNIP4-201ENST00000359001 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 RNF146-210ENST00000608991 2169 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC7.98□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 OR4Q3-202ENST00000642117 2165 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 ATP10B-202ENST00000327245 7566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 ZNF260-202ENST00000523638 5666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 ADAMTS3-204ENST00000622135 4479 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 CSDE1-204ENST00000369530 3774 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 DUXAP8-203ENST00000437781 2398 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 TMEM170B-201ENST00000379426 8362 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.98□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 CABYR-207ENST00000486759 1664 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 CTNND1-233ENST00000532787 5751 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 CABYR-216ENST00000621648 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 MAGT1-204ENST00000610432 4019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 MPPED2-201ENST00000358117 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 PTK2-228ENST00000521059 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 LIN28B-201ENST00000345080 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 LINC02426-201ENST00000550506 1372 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 SEPT14-201ENST00000388975 3785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 CCR9-201ENST00000355983 2653 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 CHRM5-202ENST00000557872 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 PDE11A-203ENST00000409504 2102 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 ZNF969P-201ENST00000510345 2341 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 SLC15A2-205ENST00000489711 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 LINC02044-201ENST00000490139 2502 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 CX3CR1-202ENST00000399220 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 LIMCH1-201ENST00000313860 6165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 CS-201ENST00000351328 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 RN7SKP33-201ENST00000410942 340 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 Z82198.3-201ENST00000421145 199 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 OR6K4P-201ENST00000423179 955 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 VDAC1P2-201ENST00000423609 850 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 AC008073.2-201ENST00000428344 792 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 AL590302.1-201ENST00000431017 359 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 AC013403.1-201ENST00000436954 263 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 NFIA-AS2-203ENST00000438559 1275 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 AC000041.1-201ENST00000439655 175 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 AL136982.3-201ENST00000454709 688 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 AP002371.1-201ENST00000463604 433 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 AL157777.1-201ENST00000468100 304 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 AC129807.1-201ENST00000471614 591 ntTSL 4 BASIC7.97□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 AC026826.1-201ENST00000493002 361 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 AC008885.2-201ENST00000509506 930 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 SETP21-201ENST00000514799 892 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 LINC01484-201ENST00000517733 555 ntTSL 4 BASIC7.97□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 NPM1P6-201ENST00000521088 871 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 OR5AK3P-201ENST00000527486 1297 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 AC090791.1-201ENST00000530960 492 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 AC136285.2-201ENST00000562873 378 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 AC026462.3-201ENST00000565153 557 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 NUDT7-206ENST00000568787 678 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 RPL29P33-201ENST00000587474 316 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 CLPTM1LP1-201ENST00000604519 484 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 HNRNPA3P9-201ENST00000604913 979 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 AL645933.2-201ENST00000606743 1207 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 HOXA11-AS1_3.1-201ENST00000613383 98 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 Metazoa_SRP.77-201ENST00000616915 252 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 AC048341.3-201ENST00000619323 491 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 CLUHP10-201ENST00000631979 980 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 SLC22A25-201ENST00000306494 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 SEMA5A-AS1-201ENST00000510879 1679 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 SENP8-201ENST00000340912 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 EPB41-201ENST00000343067 5956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 AP002364.1-201ENST00000623330 3386 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 MGAM-209ENST00000620571 6483 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 AL136981.1-203ENST00000451452 3844 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 CDH12-208ENST00000522262 3028 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 AMY1A-201ENST00000370083 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 AC009948.3-201ENST00000603415 1798 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 AL034417.4-202ENST00000642135 2236 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 ZMAT1-206ENST00000540921 3139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 ZNF268-209ENST00000541009 3773 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 HHIP-201ENST00000296575 10072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 AC012668.3-202ENST00000417485 1642 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 SUN3-201ENST00000297325 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 TCF12-207ENST00000557843 4076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 BROX-201ENST00000340934 4124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 AC096992.2-201ENST00000609553 1684 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 GPCPD1-201ENST00000379019 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 SF3B3-201ENST00000302516 9720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 MARK2P4-201ENST00000503381 2380 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 SLC36A4-206ENST00000529184 1917 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 TRIM49B-202ENST00000622138 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
NEDD1Q8NHV4 ANK2-203ENST00000394537 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
NEDD1Q8NHV4 SPEF2-211ENST00000509059 4707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
NEDD1Q8NHV4 Z97989.1-201ENST00000531702 2421 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
NEDD1Q8NHV4 PAPOLG-201ENST00000238714 4263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
NEDD1Q8NHV4 VANGL1-202ENST00000355485 8691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms