Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 OR8D4-201ENST00000321355 1331 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 MIPEPP2-201ENST00000422560 1819 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 GABRA1-218ENST00000637827 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 SCAMP1-206ENST00000618166 1358 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 COX6B1P3-201ENST00000312310 260 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 LINC00314-201ENST00000324988 607 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 MYO3A-202ENST00000376301 727 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AC007068.1-201ENST00000396690 844 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 KCNJ13-202ENST00000409779 1099 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AP000295.1-201ENST00000433395 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 ATP6V1E1P1-201ENST00000439215 681 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 ATP5LP2-201ENST00000440646 311 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 PPIAP27-201ENST00000453800 265 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AC118758.1-202ENST00000454719 225 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 TAAR4P-201ENST00000454843 1039 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AC068228.1-201ENST00000461723 211 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AC023194.2-201ENST00000465398 406 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AC117386.1-201ENST00000474444 606 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AC122718.2-201ENST00000505325 591 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AC117383.1-201ENST00000507698 422 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 RNU6-943P-201ENST00000516960 98 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AC069208.1-201ENST00000540811 676 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 LINC02193-202ENST00000566864 719 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AC008833.1-201ENST00000611633 691 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 MIR6809-201ENST00000612189 116 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AL137789.1-204ENST00000623503 666 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AJ239318.1-201ENST00000624445 607 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AL442128.2-201ENST00000620246 1824 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AC099811.1-201ENST00000597755 1496 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AL162726.3-201ENST00000637606 1301 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 CYLD-207ENST00000564326 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 LINC02060-201ENST00000506041 1626 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 GPR89A-213ENST00000534502 1644 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 FSHB-202ENST00000417547 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 CTDSPL2-204ENST00000558966 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 WDYHV1-208ENST00000523984 1491 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 ADPRM-201ENST00000379774 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 ZRSR2-202ENST00000380308 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 DEFB135-201ENST00000382208 234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 BTBD9-203ENST00000403056 1155 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 ICA1L-206ENST00000418208 602 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 ALMS1-IT1-201ENST00000441587 2107 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 MEOX2-AS1-201ENST00000442176 697 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AC092106.1-201ENST00000444291 373 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AL161722.1-201ENST00000446972 1032 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 MTND6P5-201ENST00000448266 512 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 RPL36A-206ENST00000471855 399 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AC099521.1-201ENST00000482557 334 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 EIF3LP3-201ENST00000495197 822 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 RBBP4P1-201ENST00000502424 1276 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 LDHAP1-201ENST00000509421 992 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AC026782.2-201ENST00000510845 636 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 SCARNA18.1-201ENST00000516330 83 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 WBP1LP3-201ENST00000523033 208 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AC026894.1-201ENST00000532930 850 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AL133481.2-201ENST00000538322 367 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AC007956.1-201ENST00000555623 542 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AC009396.2-201ENST00000555954 700 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 INO80-AS1-201ENST00000558967 312 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AC087501.3-201ENST00000576477 513 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AC008507.3-201ENST00000585753 472 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AC010320.2-201ENST00000593857 551 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AC108673.3-201ENST00000609183 335 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AL591926.1-201ENST00000620542 217 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 OR11H2-202ENST00000641517 1085 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AL513548.1-201ENST00000562904 1724 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AC027279.1-201ENST00000568885 4284 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.9 ms