Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 NXF2B-203ENST00000604395 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 NXF2-201ENST00000604790 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 GAPVD1-215ENST00000470056 8923 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 CACNA1E-210ENST00000621791 16171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 CLTC-210ENST00000579456 2301 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 EPHA3-203ENST00000494014 3085 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 DAAM1-202ENST00000395125 5806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 FBXL17-203ENST00000496714 3773 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 AMY1B-202ENST00000370080 1787 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 LRMDA-208ENST00000496424 3923 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 GCSAML-210ENST00000536561 4063 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 WDR93-204ENST00000558000 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 HMGN2P46-204ENST00000409454 1923 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 LARP1B-203ENST00000432347 2707 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 AMELX-201ENST00000348912 737 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 SNORA70.5-201ENST00000365519 135 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 PAGE2-201ENST00000374965 456 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 PFKFB1-201ENST00000374992 1156 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 OR52E6-202ENST00000379946 954 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 AMELX-202ENST00000380712 835 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 AMELX-203ENST00000380714 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 MIR152-201ENST00000385212 87 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 RNA5SP53-201ENST00000391299 120 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 RN7SKP166-201ENST00000410812 305 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 EIF4A1P2-201ENST00000422633 1220 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 AL606534.4-201ENST00000427176 792 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 RPL14P5-201ENST00000436474 730 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 YWHAZP7-201ENST00000436906 631 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 SEPHS1P4-201ENST00000446112 1176 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 AC044781.1-201ENST00000446193 570 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 AL646090.1-201ENST00000449928 492 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 AL392046.1-201ENST00000450742 569 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 DNAJC19P8-201ENST00000452887 259 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 RPS3AP43-201ENST00000479743 781 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 AL591122.1-201ENST00000487348 492 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 AC008770.1-202ENST00000495324 516 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 AC092834.1-201ENST00000506514 442 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 SUMO2P7-201ENST00000511179 285 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 SCARNA6-201ENST00000515982 265 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 EEF1B2P2-201ENST00000519625 676 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 AC087664.2-202ENST00000521274 515 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 AP001803.1-201ENST00000525668 147 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 AC016526.2-201ENST00000554225 520 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 AC110023.1-201ENST00000554318 457 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 AC016526.1-201ENST00000555465 520 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 LINC01146-206ENST00000556684 361 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 LINC02188-201ENST00000562064 550 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 AC091932.1-201ENST00000569381 427 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 AC019131.1-201ENST00000583654 622 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 AC068408.2-201ENST00000584566 439 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 AC111186.1-201ENST00000604684 130 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 AL031601.1-201ENST00000605702 394 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 AL353726.1-201ENST00000614041 1000 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 PPP3CB-AS1-215ENST00000620559 656 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 Metazoa_SRP.106-201ENST00000622471 296 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 AP001962.1-201ENST00000624114 559 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 AL049541.2-201ENST00000626377 555 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 AC135068.11-201ENST00000636378 921 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 DYNC2LI1-210ENST00000605786 1346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 AC021755.1-201ENST00000559747 1447 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 AC010329.1-201ENST00000593903 8328 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 EXPH5-203ENST00000525344 6542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 CEP120-202ENST00000306481 4629 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 KALRN-204ENST00000360013 10806 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 TMEM67-205ENST00000453321 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 FGFR2-205ENST00000357555 3690 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 FIRRE-202ENST00000637577 1635 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 C2orf66-201ENST00000342506 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 SULT1E1-201ENST00000226444 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 CATSPER2-202ENST00000381761 1758 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 PLXNA4-201ENST00000321063 13061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 OSBPL1A-202ENST00000357041 1869 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 AC046144.1-201ENST00000478559 1853 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 ZNF766-201ENST00000439461 6298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 NCOA6-202ENST00000374796 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 OR10G4-202ENST00000641521 3623 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 ANKRD44-202ENST00000328737 3686 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 OR2H1-201ENST00000377132 2253 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 FKBP5-202ENST00000536438 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 ANKFN1-201ENST00000318698 2426 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 DSC1-202ENST00000257198 4225 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 SEMA3A-204ENST00000436949 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 B3GALT5-203ENST00000380620 13170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 CLCA3P-203ENST00000490028 2781 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 NCOA2-201ENST00000452400 8447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 MR1-209ENST00000617803 7584 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 OLMALINC-203ENST00000641087 3779 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 OR10D1P-201ENST00000355343 936 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 IGKV7-3-201ENST00000357453 298 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.8 ms