Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 NQO1-204ENST00000439109 924 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 AC108039.2-201ENST00000440214 359 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 KDM4A-AS1-205ENST00000453015 647 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 RANP1-206ENST00000455094 651 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 RPS27AP17-201ENST00000463344 455 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 AC007849.1-201ENST00000469794 513 ntTSL 4 BASIC9.53□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 AC008676.1-202ENST00000520658 545 ntTSL 4 BASIC9.53□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 AC079363.1-201ENST00000551366 1125 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 AC084033.3-201ENST00000551421 451 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 VDAC1P5-201ENST00000603132 844 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 BX005040.2-201ENST00000620504 370 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 SPTY2D1-AS1-206ENST00000636011 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 SYNE1-206ENST00000367253 5189 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 TMEM87A-203ENST00000448392 3049 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 PTPDC1-201ENST00000288976 4398 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 FAM193A-204ENST00000505311 4110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 AL591543.1-202ENST00000642095 4149 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 AC020549.1-201ENST00000536916 1440 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 ABCA1-202ENST00000374736 10494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 NOSTRIN-207ENST00000445023 1569 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 MIAT-218ENST00000613780 10143 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 COA1-203ENST00000395879 2448 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 CORIN-205ENST00000504584 2417 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 IKZF3-213ENST00000439167 1879 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 STXBP5-AS1-209ENST00000606831 2025 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 OVCH1-201ENST00000318184 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 HTR2A-201ENST00000378688 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 GON4L-217ENST00000615926 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 MCM8-202ENST00000378883 3574 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 AURKA-206ENST00000395913 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 UBE2V2-207ENST00000523111 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 WDR19-201ENST00000399820 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 LINC00672-201ENST00000583195 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 CLSTN2-AS1-201ENST00000513309 2693 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 TRIM66-201ENST00000299550 9753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 VIT-202ENST00000379242 2810 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 TSPAN8-202ENST00000393330 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 LINC02418-202ENST00000567788 4592 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 NXPE4-202ENST00000424261 1687 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 OPTN-202ENST00000378747 3400 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 MAPK10-228ENST00000512689 2583 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 OTOA-201ENST00000286149 3471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 FHL1-203ENST00000370676 833 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 NCR2-201ENST00000373083 1154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 TRPM3-206ENST00000377097 554 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
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MKRN3Q13064 ATP5HP3-201ENST00000396994 486 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 AL161909.1-201ENST00000397390 712 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 PPIL1P1-201ENST00000423936 499 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 AL133268.4-201ENST00000424868 472 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 AC005033.1-201ENST00000428904 813 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 Z68868.1-201ENST00000429048 544 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 AC012506.4-202ENST00000430051 572 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 AC105393.2-201ENST00000431911 549 ntTSL 4 BASIC9.52□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 ADAM7-203ENST00000441335 1417 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 RPS29P5-201ENST00000452777 171 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 HNRNPCP7-201ENST00000456056 905 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 RPL3P10-201ENST00000476002 1164 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 COX7B-203ENST00000481445 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 AC099521.1-201ENST00000482557 334 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
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MKRN3Q13064 RN7SL182P-201ENST00000496499 300 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 AC113208.1-201ENST00000497944 318 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 MRPL49P1-201ENST00000505951 535 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
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MKRN3Q13064 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 IGHVIII-13-1-201ENST00000517613 291 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 AC079385.3-201ENST00000552415 809 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
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MKRN3Q13064 AC090826.1-201ENST00000564109 915 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 STX8-209ENST00000574431 731 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 AC027796.1-201ENST00000575593 512 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 AC090283.1-201ENST00000582101 265 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 AL589863.1-201ENST00000595383 631 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 RPS4XP16-202ENST00000595905 807 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 AC005392.3-201ENST00000607109 459 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 AC106782.6-201ENST00000611264 512 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 ARID1A-209ENST00000615191 3804 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 AC087565.2-201ENST00000637695 952 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 GEMIN6-201ENST00000281950 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 MYH2-206ENST00000622564 2379 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 AC084816.1-210ENST00000540895 1920 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 LDHA-204ENST00000396222 1766 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 SYNE1-211ENST00000413186 4860 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 RXFP2-202ENST00000380314 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 NFIA-208ENST00000407417 2123 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
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