Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 AC011405.1-204ENST00000512875 731 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 AC097173.2-201ENST00000518701 474 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 WBP1LP3-201ENST00000523033 208 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 OR8Q1P-201ENST00000526467 655 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 AC087636.1-201ENST00000554787 573 ntTSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 U95743.1-201ENST00000573369 1001 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 AC087501.3-201ENST00000576477 513 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 AC005288.1-201ENST00000582842 860 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 AP001011.1-201ENST00000583546 690 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 AC005244.2-201ENST00000585228 718 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 HIRAP1-201ENST00000605318 787 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 AL023583.1-201ENST00000607518 1143 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 Metazoa_SRP.70-201ENST00000612622 273 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 AC073592.6-201ENST00000624271 415 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 AC005618.4-201ENST00000625053 554 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 AP001052.1-201ENST00000626421 99 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 FABP2-201ENST00000274024 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 CASP1-215ENST00000533400 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 MAK-204ENST00000536370 3767 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 LRRC7-202ENST00000310961 6507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 AC117409.1-201ENST00000470499 1310 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 SCGB3A2-201ENST00000296694 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 OR4C11-201ENST00000302231 1045 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 RN7SKP275-201ENST00000364626 301 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 RN7SKP187-201ENST00000365536 330 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 AC087752.1-201ENST00000391360 558 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 AL158827.1-201ENST00000416300 391 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 AL356806.1-201ENST00000422524 916 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
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PTP4A2Q12974 AC005008.2-201ENST00000431501 715 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 AC069154.1-201ENST00000432914 542 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 LINC01828-201ENST00000445514 531 ntTSL 4 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 AL354793.1-201ENST00000446028 713 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 AC105021.1-201ENST00000455347 590 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
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PTP4A2Q12974 RN7SL170P-201ENST00000487098 295 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
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PTP4A2Q12974 AC105420.1-201ENST00000504389 582 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
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PTP4A2Q12974 LINC02451-202ENST00000548764 579 ntTSL 4 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 AC074029.2-201ENST00000551045 634 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 AL121839.1-201ENST00000556233 1185 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
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PTP4A2Q12974 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
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PTP4A2Q12974 TTN-AS1-226ENST00000588716 604 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 AL031601.1-201ENST00000605702 394 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 LINC02343-201ENST00000605909 573 ntTSL 4 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 AL035661.1-201ENST00000620459 1144 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
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PTP4A2Q12974 AC020923.1-201ENST00000624021 917 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 AC073593.1-201ENST00000624500 411 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 PRKCH-228ENST00000640011 285 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 AL133284.1-201ENST00000423715 4996 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 AC009135.2-201ENST00000624136 1768 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 MIR4500HG-201ENST00000436290 1675 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 KCNMB2-210ENST00000617329 2214 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 LINC02030-201ENST00000492683 1602 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 FRMD6-205ENST00000554167 4176 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 TRPM7-201ENST00000313478 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 NFIB-204ENST00000380953 2381 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 PDZK1P1-202ENST00000425209 1350 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 AC099506.1-201ENST00000567359 4037 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 AC114774.1-201ENST00000507410 1770 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 NAV3-201ENST00000397909 9821 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 AC004386.1-201ENST00000393214 761 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
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