Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 OR10AB1P-202ENST00000641219 1686 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 WDR95P-201ENST00000425638 1542 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 MPDZ-202ENST00000319217 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 ZRANB3-210ENST00000536680 6943 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 ZNF644-204ENST00000370440 5702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 ALB-220ENST00000621628 1606 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 RGSL1-201ENST00000294854 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 FRMD6-205ENST00000554167 4176 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 SPRY3-201ENST00000302805 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 NAT2-201ENST00000286479 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 MTND5P23-201ENST00000430812 1655 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 CHD2-208ENST00000626874 7764 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 OR5B12-201ENST00000302572 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 AL353740.1-201ENST00000366253 575 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 FIG4-202ENST00000368941 791 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 C1orf194-202ENST00000369945 534 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 MIR7-1-201ENST00000384871 110 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 TRGV10-201ENST00000390341 512 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 DHFRP5-201ENST00000406944 564 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 AC009502.1-203ENST00000416861 496 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 AC007064.3-201ENST00000422608 359 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 AC062021.1-201ENST00000429008 557 ntTSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 PMCHL1-204ENST00000430902 659 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 AC019117.1-202ENST00000439046 589 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 AL138899.2-201ENST00000439139 499 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
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HOXD13P35453 AC019117.1-204ENST00000451792 442 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
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HOXD13P35453 LINC01448-201ENST00000455947 1171 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
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HOXD13P35453 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
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HOXD13P35453 AC007014.1-201ENST00000572828 610 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
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HOXD13P35453 AC009120.7-201ENST00000623452 780 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
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HOXD13P35453 AC092375.1-202ENST00000639452 404 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
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HOXD13P35453 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 TTC3-201ENST00000354749 9084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
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HOXD13P35453 AC027279.1-201ENST00000568885 4284 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
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HOXD13P35453 LSAMP-207ENST00000539563 8821 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 AC008505.1-203ENST00000637345 1766 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 METTL6-203ENST00000443029 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 AC127164.1-201ENST00000548738 4196 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 MGP-201ENST00000228938 694 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 FAM162A-201ENST00000232125 801 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 RNA5SP394-201ENST00000364216 119 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 RNU6-564P-201ENST00000410983 104 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 HMGN1P20-201ENST00000411849 300 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 AL136131.2-201ENST00000424283 348 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 AC000095.2-201ENST00000424407 768 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 VN1R21P-201ENST00000426703 765 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 AC092168.2-201ENST00000430586 717 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 AL353751.1-203ENST00000437032 603 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 SUMO2P3-201ENST00000438311 288 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 AL137186.1-201ENST00000440436 480 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 AL136988.2-201ENST00000440729 861 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 AL035530.1-201ENST00000446887 331 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
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