Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 AC007786.1-202ENST00000590607 443 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 ZNF397-211ENST00000592264 1104 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 LINC00907-208ENST00000593051 1092 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 ZNF85-206ENST00000596476 1259 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 SNORA74.4-201ENST00000607595 199 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 AC078899.5-201ENST00000612475 178 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 DARS-AS1-227ENST00000627442 633 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 TTN-AS1-268ENST00000629094 604 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 TRIM77-201ENST00000398290 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 SULT1C2-205ENST00000437390 1359 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 LINC00517-202ENST00000554257 3460 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 GPR89A-203ENST00000462900 1527 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 KARSP3-201ENST00000571212 1504 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 PSG6-204ENST00000402603 1412 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 MGC32805-205ENST00000510972 1424 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 VDAC2-214ENST00000543351 1424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 PWRN1-211ENST00000568609 1443 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 OR1E1-201ENST00000322608 1307 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 AC108751.5-201ENST00000492880 1336 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 CCDC102B-210ENST00000584156 1554 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 AC017104.4-201ENST00000636283 1592 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 Z98755.1-201ENST00000407015 1384 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 BTG4-203ENST00000525791 1394 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 RNA5SP382-201ENST00000363355 112 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 LDHAP5-201ENST00000394996 622 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 AL161725.1-203ENST00000415004 1081 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 TEX50-201ENST00000417563 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 AL596451.1-201ENST00000419824 572 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 AL157884.1-201ENST00000424561 454 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 AC244394.2-201ENST00000425109 735 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
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LINC00587B1AMM8 GPC6-AS1-201ENST00000436329 698 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 GNA14-AS1-201ENST00000439145 605 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
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LINC00587B1AMM8 AC084026.1-201ENST00000522028 564 ntTSL 4 BASIC4.2□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 AP001831.1-201ENST00000524610 411 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
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LINC00587B1AMM8 LINC01146-203ENST00000555996 459 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 USP3-AS1-204ENST00000559861 620 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
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LINC00587B1AMM8 CD24P2-201ENST00000565486 219 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 AC022872.1-201ENST00000568391 781 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
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LINC00587B1AMM8 BACH1-IT2-202ENST00000608072 691 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
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LINC00587B1AMM8 JAKMIP2-AS1-202ENST00000627433 831 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 ZNF253-205ENST00000640599 1208 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 OR10G8-202ENST00000641224 1033 ntAPPRIS P1 BASIC4.2□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 CDH8-205ENST00000577730 8009 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 SOHLH2-202ENST00000379881 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 LCA5L-203ENST00000380671 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 MTRNR2L8-201ENST00000536684 1303 ntAPPRIS P1 BASIC4.2□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 OR11H5P-202ENST00000641612 1325 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 RBM41-201ENST00000372479 1662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 AC079097.1-201ENST00000512187 1399 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 OR2M4-201ENST00000306687 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.19□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 FASLG-201ENST00000340030 917 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 HMGN2-201ENST00000361427 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 MIR448-201ENST00000362131 111 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 AC074375.1-201ENST00000372993 192 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 BTBD9-203ENST00000403056 1155 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 RNA5SP177-201ENST00000410122 107 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
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