Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 AL807757.2-201ENST00000416455 779 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 AL157884.1-201ENST00000424561 454 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 AC115285.1-201ENST00000424879 736 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01435-201ENST00000425050 722 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 MED28P4-201ENST00000433137 572 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 GTF2IP14-201ENST00000441415 586 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 RPL5P10-201ENST00000445207 894 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 AC211433.1-201ENST00000450426 686 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 AC073409.1-201ENST00000451749 269 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 AC009158.1-205ENST00000452511 895 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 AL139156.3-201ENST00000454802 394 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SL254P-201ENST00000460609 284 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 RPL23AP64-201ENST00000469465 435 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 CD200R1-205ENST00000490004 778 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02430-201ENST00000504755 476 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 AC093720.1-201ENST00000505681 714 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 AC091874.2-201ENST00000505889 720 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01088-205ENST00000509088 756 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 AC106800.2-201ENST00000514009 1103 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 AL357153.3-201ENST00000553982 611 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 AL845552.1-201ENST00000556820 323 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 AC040977.1-201ENST00000573222 343 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 AC004917.1-204ENST00000592441 701 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01435-212ENST00000601212 742 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA74.4-201ENST00000607595 199 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 MIR6071-201ENST00000616741 78 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 AL133342.1-201ENST00000618168 366 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 ZNHIT3-208ENST00000619730 926 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 AC068880.4-201ENST00000623082 495 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 AP002967.1-201ENST00000624203 539 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 AC126544.2-201ENST00000625174 749 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 LYRM2-211ENST00000626778 696 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 PSMD10P2-203ENST00000627340 914 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 AC103703.1-201ENST00000634783 663 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 OR2AK2-202ENST00000641852 1008 ntAPPRIS P2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 IQCH-202ENST00000358767 3062 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 ECT2-216ENST00000540509 4406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 LINC-ROR-201ENST00000553704 2603 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 MAGI2-235ENST00000637282 3174 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 ENSA-214ENST00000513281 1369 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 CNIH1-201ENST00000216416 4793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF571-205ENST00000590751 1700 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 TTC3-201ENST00000354749 9084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF699-203ENST00000591998 3358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 MIR3681HG-201ENST00000412294 2183 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 RNF19BPY-201ENST00000458209 1550 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 SDHAF3-201ENST00000360382 731 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD16-201ENST00000362803 99 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 KRTAP3-1-201ENST00000391588 594 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP198-201ENST00000410376 127 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 C9orf147-201ENST00000412934 584 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 DHFRP2-201ENST00000414224 547 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 RCC2P2-201ENST00000422174 918 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 AJ239321.1-201ENST00000424255 564 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 AL139120.1-201ENST00000443652 358 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 POU5F1P5-201ENST00000445059 658 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 AF127577.1-201ENST00000446301 562 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 XXYLT1-AS2-202ENST00000447975 784 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 BBIP1-208ENST00000454061 812 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
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SH3BP1Q9Y3L3 AC116345.3-201ENST00000508255 449 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 HSD3BP3-201ENST00000514706 994 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 ODF1-202ENST00000518835 368 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 AC010609.1-201ENST00000519375 569 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 AC087664.2-202ENST00000521274 515 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 COX6C-209ENST00000523016 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 OR8G5-201ENST00000524943 1041 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 TOMM20P1-201ENST00000534518 427 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 AC020611.2-201ENST00000535594 671 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 CKS1BP1-201ENST00000555221 240 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 TPRX1P1-201ENST00000557620 319 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 AC002310.3-201ENST00000569728 723 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF174-204ENST00000572544 1002 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 MTCO2P2-201ENST00000591258 225 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01930-201ENST00000602672 870 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 AL953862.2-201ENST00000603089 820 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 AC073046.2-201ENST00000604756 527 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 RPSAP75-201ENST00000605848 301 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 AC084036.1-201ENST00000609190 508 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 AC004477.3-201ENST00000614061 590 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 REV3L-214ENST00000619481 969 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 CHD2-215ENST00000628375 3202 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 WDR72-208ENST00000614174 4224 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF566-202ENST00000424129 2644 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 TAF12-202ENST00000373824 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 ZMYM4-201ENST00000314607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 CDH18-210ENST00000511273 2318 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 CASC19-248ENST00000641674 1356 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
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