Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 MIR3189-201ENST00000578735 73 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AC025809.1-201ENST00000585336 560 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AC005180.2-201ENST00000585620 562 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AC005242.1-201ENST00000585658 438 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AC011492.1-201ENST00000600023 315 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AC112491.1-201ENST00000602890 248 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 ELOCP35-201ENST00000604289 336 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 BPIFA4P-204ENST00000605211 656 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AL021368.3-201ENST00000607119 578 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AC092902.2-219ENST00000608488 822 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AP005229.2-201ENST00000609980 697 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AC008759.3-201ENST00000613300 508 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 Metazoa_SRP.66-201ENST00000615609 282 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AC048341.3-201ENST00000619323 491 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 ZNHIT3-208ENST00000619730 926 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 CU638689.1-201ENST00000623225 897 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 CU634019.4-201ENST00000623347 897 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AC007842.1-201ENST00000597336 2039 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 CSTF3-201ENST00000323959 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 NAPEPLD-203ENST00000417955 4988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 CHD6-202ENST00000373222 2477 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 LINC02060-201ENST00000506041 1626 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 POT1-202ENST00000393329 3950 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 SCAMP1-206ENST00000618166 1358 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 DSC1-201ENST00000257197 4271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 LINC01179-201ENST00000507838 2163 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 CPS1-212ENST00000619804 1542 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 TLR10-208ENST00000622002 3673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 OR4K5-201ENST00000315915 1078 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 WFDC11-201ENST00000324384 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 PIH1D3-201ENST00000336387 993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 RNU6-697P-201ENST00000363348 107 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 MIR433-201ENST00000384837 93 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 MIR191-201ENST00000384873 92 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 AC104823.1-201ENST00000413290 989 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 LINC00352-201ENST00000425800 552 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 AL359878.2-201ENST00000435531 407 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 ELOCP11-201ENST00000436690 332 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 GTF2IP14-201ENST00000441415 586 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 ELOCP16-201ENST00000444494 332 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 AL355390.2-201ENST00000446691 880 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 RPL7L1P3-201ENST00000455249 689 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 RN7SL39P-201ENST00000462264 297 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 MARK2P8-201ENST00000476069 952 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 RN7SL369P-201ENST00000477138 299 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 RN7SL326P-201ENST00000477493 296 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 AC114728.1-201ENST00000488289 483 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 AC096746.1-201ENST00000501965 1042 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 AC114956.1-201ENST00000504277 512 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 AC069306.1-201ENST00000507006 843 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 LINC02503-201ENST00000510505 812 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 AC111000.6-201ENST00000514471 709 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 RNA5SP418-201ENST00000515951 117 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 HMGB1P46-201ENST00000520062 610 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 OR56A7P-201ENST00000524865 941 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 CYCSP25-201ENST00000525280 316 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 OR4A41P-201ENST00000533053 928 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 AC023538.1-201ENST00000534576 736 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 TDGP1-201ENST00000543961 1229 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 AC008055.1-201ENST00000547032 609 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 AC084824.2-201ENST00000548906 345 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 AC025031.1-201ENST00000552634 562 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 SYNE2-210ENST00000553455 674 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 PWRN1-208ENST00000567647 561 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 MIR3157-201ENST00000578688 85 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 LINC01855-201ENST00000585520 396 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 AC005332.4-201ENST00000592752 579 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 AL589863.1-201ENST00000595383 631 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 DYNLL1P1-201ENST00000595442 269 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 AL589765.6-201ENST00000601909 549 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 AC006924.1-201ENST00000610750 559 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 AC015819.1-201ENST00000613588 663 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 AL356752.1-201ENST00000615844 593 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 AL513314.2-202ENST00000617077 536 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 AC009804.2-201ENST00000637566 3032 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 ADGRL2-202ENST00000359929 4674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 TCP1P3-201ENST00000414406 1498 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 MSL3P1-202ENST00000440028 1468 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.5 ms